Protein–RNA interactions for Protein: Q969M2

GJA10, Gap junction alpha-10 protein, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA10Q969M2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
GJA10Q969M2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
GJA10Q969M2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
GJA10Q969M2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
GJA10Q969M2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
GJA10Q969M2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
GJA10Q969M2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
GJA10Q969M2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GJA10Q969M2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
GJA10Q969M2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
GJA10Q969M2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
GJA10Q969M2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
GJA10Q969M2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
GJA10Q969M2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
GJA10Q969M2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
GJA10Q969M2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
GJA10Q969M2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
GJA10Q969M2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
GJA10Q969M2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
GJA10Q969M2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
GJA10Q969M2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
GJA10Q969M2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
GJA10Q969M2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
GJA10Q969M2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
GJA10Q969M2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
GJA10Q969M2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
GJA10Q969M2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
GJA10Q969M2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
GJA10Q969M2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
GJA10Q969M2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
GJA10Q969M2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
GJA10Q969M2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
GJA10Q969M2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
GJA10Q969M2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
GJA10Q969M2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
GJA10Q969M2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
GJA10Q969M2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
GJA10Q969M2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
GJA10Q969M2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
GJA10Q969M2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
GJA10Q969M2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
GJA10Q969M2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
GJA10Q969M2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GJA10Q969M2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
GJA10Q969M2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
GJA10Q969M2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
GJA10Q969M2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GJA10Q969M2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GJA10Q969M2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
GJA10Q969M2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GJA10Q969M2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GJA10Q969M2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
GJA10Q969M2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
GJA10Q969M2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
GJA10Q969M2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
GJA10Q969M2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GJA10Q969M2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
GJA10Q969M2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
GJA10Q969M2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
GJA10Q969M2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
GJA10Q969M2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
GJA10Q969M2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
GJA10Q969M2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GJA10Q969M2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
GJA10Q969M2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
GJA10Q969M2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
GJA10Q969M2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
GJA10Q969M2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
GJA10Q969M2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
GJA10Q969M2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
GJA10Q969M2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
GJA10Q969M2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
GJA10Q969M2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
GJA10Q969M2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
GJA10Q969M2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
GJA10Q969M2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
GJA10Q969M2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
GJA10Q969M2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
GJA10Q969M2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
GJA10Q969M2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
GJA10Q969M2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
GJA10Q969M2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
GJA10Q969M2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
GJA10Q969M2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
GJA10Q969M2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
GJA10Q969M2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
GJA10Q969M2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
GJA10Q969M2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
GJA10Q969M2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
GJA10Q969M2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
GJA10Q969M2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
GJA10Q969M2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
GJA10Q969M2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
GJA10Q969M2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
GJA10Q969M2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
GJA10Q969M2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GJA10Q969M2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
GJA10Q969M2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
GJA10Q969M2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
GJA10Q969M2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms