Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GATA6Q92908 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GATA6Q92908 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GATA6Q92908 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GATA6Q92908 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GATA6Q92908 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GATA6Q92908 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
GATA6Q92908 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GATA6Q92908 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GATA6Q92908 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GATA6Q92908 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GATA6Q92908 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GATA6Q92908 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GATA6Q92908 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GATA6Q92908 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GATA6Q92908 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GATA6Q92908 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GATA6Q92908 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GATA6Q92908 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GATA6Q92908 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GATA6Q92908 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GATA6Q92908 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GATA6Q92908 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GATA6Q92908 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GATA6Q92908 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GATA6Q92908 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GATA6Q92908 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GATA6Q92908 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GATA6Q92908 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
GATA6Q92908 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GATA6Q92908 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GATA6Q92908 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GATA6Q92908 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GATA6Q92908 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GATA6Q92908 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GATA6Q92908 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GATA6Q92908 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GATA6Q92908 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GATA6Q92908 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GATA6Q92908 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GATA6Q92908 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GATA6Q92908 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GATA6Q92908 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
GATA6Q92908 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GATA6Q92908 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GATA6Q92908 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
GATA6Q92908 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GATA6Q92908 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GATA6Q92908 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GATA6Q92908 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GATA6Q92908 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GATA6Q92908 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GATA6Q92908 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
GATA6Q92908 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GATA6Q92908 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GATA6Q92908 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GATA6Q92908 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GATA6Q92908 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GATA6Q92908 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
GATA6Q92908 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
GATA6Q92908 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GATA6Q92908 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GATA6Q92908 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GATA6Q92908 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GATA6Q92908 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GATA6Q92908 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GATA6Q92908 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GATA6Q92908 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GATA6Q92908 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GATA6Q92908 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
GATA6Q92908 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GATA6Q92908 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GATA6Q92908 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GATA6Q92908 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GATA6Q92908 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GATA6Q92908 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GATA6Q92908 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GATA6Q92908 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GATA6Q92908 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GATA6Q92908 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GATA6Q92908 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GATA6Q92908 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GATA6Q92908 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GATA6Q92908 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GATA6Q92908 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
GATA6Q92908 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GATA6Q92908 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GATA6Q92908 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GATA6Q92908 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GATA6Q92908 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GATA6Q92908 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GATA6Q92908 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GATA6Q92908 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GATA6Q92908 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GATA6Q92908 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GATA6Q92908 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GATA6Q92908 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GATA6Q92908 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GATA6Q92908 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GATA6Q92908 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms