Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZM2

Sh2b1, SH2B adapter protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2b1Q91ZM2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sh2b1Q91ZM2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sh2b1Q91ZM2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sh2b1Q91ZM2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Sh2b1Q91ZM2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Sh2b1Q91ZM2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sh2b1Q91ZM2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Sh2b1Q91ZM2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Sh2b1Q91ZM2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sh2b1Q91ZM2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sh2b1Q91ZM2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sh2b1Q91ZM2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sh2b1Q91ZM2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sh2b1Q91ZM2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sh2b1Q91ZM2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Sh2b1Q91ZM2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Sh2b1Q91ZM2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Sh2b1Q91ZM2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sh2b1Q91ZM2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sh2b1Q91ZM2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sh2b1Q91ZM2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sh2b1Q91ZM2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sh2b1Q91ZM2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sh2b1Q91ZM2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sh2b1Q91ZM2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sh2b1Q91ZM2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sh2b1Q91ZM2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sh2b1Q91ZM2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sh2b1Q91ZM2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sh2b1Q91ZM2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sh2b1Q91ZM2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sh2b1Q91ZM2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sh2b1Q91ZM2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sh2b1Q91ZM2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sh2b1Q91ZM2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Sh2b1Q91ZM2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sh2b1Q91ZM2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sh2b1Q91ZM2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sh2b1Q91ZM2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sh2b1Q91ZM2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sh2b1Q91ZM2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sh2b1Q91ZM2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sh2b1Q91ZM2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sh2b1Q91ZM2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sh2b1Q91ZM2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Sh2b1Q91ZM2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sh2b1Q91ZM2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sh2b1Q91ZM2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sh2b1Q91ZM2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sh2b1Q91ZM2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Sh2b1Q91ZM2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sh2b1Q91ZM2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sh2b1Q91ZM2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sh2b1Q91ZM2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sh2b1Q91ZM2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sh2b1Q91ZM2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sh2b1Q91ZM2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sh2b1Q91ZM2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sh2b1Q91ZM2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sh2b1Q91ZM2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sh2b1Q91ZM2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sh2b1Q91ZM2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sh2b1Q91ZM2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sh2b1Q91ZM2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Sh2b1Q91ZM2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sh2b1Q91ZM2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sh2b1Q91ZM2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sh2b1Q91ZM2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sh2b1Q91ZM2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sh2b1Q91ZM2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sh2b1Q91ZM2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sh2b1Q91ZM2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sh2b1Q91ZM2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sh2b1Q91ZM2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Sh2b1Q91ZM2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sh2b1Q91ZM2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Sh2b1Q91ZM2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Sh2b1Q91ZM2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sh2b1Q91ZM2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Sh2b1Q91ZM2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sh2b1Q91ZM2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sh2b1Q91ZM2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sh2b1Q91ZM2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sh2b1Q91ZM2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sh2b1Q91ZM2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sh2b1Q91ZM2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sh2b1Q91ZM2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sh2b1Q91ZM2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sh2b1Q91ZM2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sh2b1Q91ZM2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sh2b1Q91ZM2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sh2b1Q91ZM2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sh2b1Q91ZM2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Sh2b1Q91ZM2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sh2b1Q91ZM2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sh2b1Q91ZM2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sh2b1Q91ZM2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sh2b1Q91ZM2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sh2b1Q91ZM2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sh2b1Q91ZM2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162 ms