Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Snx4Q91YJ2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Snx4Q91YJ2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Snx4Q91YJ2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Snx4Q91YJ2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snx4Q91YJ2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snx4Q91YJ2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snx4Q91YJ2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snx4Q91YJ2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snx4Q91YJ2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snx4Q91YJ2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Snx4Q91YJ2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snx4Q91YJ2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snx4Q91YJ2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snx4Q91YJ2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snx4Q91YJ2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Snx4Q91YJ2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Snx4Q91YJ2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snx4Q91YJ2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snx4Q91YJ2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snx4Q91YJ2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snx4Q91YJ2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snx4Q91YJ2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Snx4Q91YJ2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Snx4Q91YJ2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Snx4Q91YJ2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snx4Q91YJ2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snx4Q91YJ2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snx4Q91YJ2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snx4Q91YJ2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snx4Q91YJ2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snx4Q91YJ2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snx4Q91YJ2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snx4Q91YJ2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snx4Q91YJ2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snx4Q91YJ2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snx4Q91YJ2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snx4Q91YJ2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snx4Q91YJ2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snx4Q91YJ2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snx4Q91YJ2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx4Q91YJ2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx4Q91YJ2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Snx4Q91YJ2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snx4Q91YJ2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snx4Q91YJ2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snx4Q91YJ2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snx4Q91YJ2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snx4Q91YJ2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snx4Q91YJ2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snx4Q91YJ2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snx4Q91YJ2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx4Q91YJ2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx4Q91YJ2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx4Q91YJ2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx4Q91YJ2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx4Q91YJ2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snx4Q91YJ2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snx4Q91YJ2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Snx4Q91YJ2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Snx4Q91YJ2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snx4Q91YJ2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Snx4Q91YJ2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx4Q91YJ2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx4Q91YJ2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snx4Q91YJ2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snx4Q91YJ2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snx4Q91YJ2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Snx4Q91YJ2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx4Q91YJ2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx4Q91YJ2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snx4Q91YJ2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snx4Q91YJ2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snx4Q91YJ2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx4Q91YJ2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snx4Q91YJ2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snx4Q91YJ2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snx4Q91YJ2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Snx4Q91YJ2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Snx4Q91YJ2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snx4Q91YJ2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snx4Q91YJ2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snx4Q91YJ2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snx4Q91YJ2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snx4Q91YJ2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snx4Q91YJ2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Snx4Q91YJ2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snx4Q91YJ2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx4Q91YJ2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx4Q91YJ2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snx4Q91YJ2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx4Q91YJ2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snx4Q91YJ2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snx4Q91YJ2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx4Q91YJ2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx4Q91YJ2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snx4Q91YJ2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx4Q91YJ2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx4Q91YJ2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx4Q91YJ2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms