Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV22

NSMCE1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE1Q8WV22 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NSMCE1Q8WV22 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NSMCE1Q8WV22 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NSMCE1Q8WV22 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NSMCE1Q8WV22 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NSMCE1Q8WV22 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NSMCE1Q8WV22 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NSMCE1Q8WV22 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NSMCE1Q8WV22 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NSMCE1Q8WV22 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NSMCE1Q8WV22 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NSMCE1Q8WV22 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NSMCE1Q8WV22 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NSMCE1Q8WV22 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NSMCE1Q8WV22 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NSMCE1Q8WV22 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NSMCE1Q8WV22 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NSMCE1Q8WV22 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NSMCE1Q8WV22 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NSMCE1Q8WV22 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NSMCE1Q8WV22 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NSMCE1Q8WV22 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NSMCE1Q8WV22 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NSMCE1Q8WV22 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NSMCE1Q8WV22 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NSMCE1Q8WV22 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NSMCE1Q8WV22 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NSMCE1Q8WV22 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NSMCE1Q8WV22 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NSMCE1Q8WV22 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NSMCE1Q8WV22 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NSMCE1Q8WV22 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NSMCE1Q8WV22 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NSMCE1Q8WV22 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NSMCE1Q8WV22 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NSMCE1Q8WV22 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NSMCE1Q8WV22 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NSMCE1Q8WV22 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NSMCE1Q8WV22 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NSMCE1Q8WV22 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NSMCE1Q8WV22 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NSMCE1Q8WV22 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NSMCE1Q8WV22 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NSMCE1Q8WV22 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NSMCE1Q8WV22 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NSMCE1Q8WV22 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NSMCE1Q8WV22 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NSMCE1Q8WV22 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NSMCE1Q8WV22 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NSMCE1Q8WV22 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
NSMCE1Q8WV22 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NSMCE1Q8WV22 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NSMCE1Q8WV22 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NSMCE1Q8WV22 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NSMCE1Q8WV22 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NSMCE1Q8WV22 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
NSMCE1Q8WV22 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NSMCE1Q8WV22 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
NSMCE1Q8WV22 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NSMCE1Q8WV22 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NSMCE1Q8WV22 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NSMCE1Q8WV22 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NSMCE1Q8WV22 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NSMCE1Q8WV22 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NSMCE1Q8WV22 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NSMCE1Q8WV22 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NSMCE1Q8WV22 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NSMCE1Q8WV22 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NSMCE1Q8WV22 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NSMCE1Q8WV22 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NSMCE1Q8WV22 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NSMCE1Q8WV22 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NSMCE1Q8WV22 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NSMCE1Q8WV22 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NSMCE1Q8WV22 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NSMCE1Q8WV22 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NSMCE1Q8WV22 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NSMCE1Q8WV22 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NSMCE1Q8WV22 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NSMCE1Q8WV22 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NSMCE1Q8WV22 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NSMCE1Q8WV22 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NSMCE1Q8WV22 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NSMCE1Q8WV22 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NSMCE1Q8WV22 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NSMCE1Q8WV22 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NSMCE1Q8WV22 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NSMCE1Q8WV22 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NSMCE1Q8WV22 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NSMCE1Q8WV22 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NSMCE1Q8WV22 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NSMCE1Q8WV22 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
NSMCE1Q8WV22 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NSMCE1Q8WV22 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NSMCE1Q8WV22 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NSMCE1Q8WV22 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NSMCE1Q8WV22 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NSMCE1Q8WV22 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NSMCE1Q8WV22 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NSMCE1Q8WV22 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms