Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBZ3

Clptm1, Cleft lip and palate transmembrane protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clptm1Q8VBZ3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Clptm1Q8VBZ3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Clptm1Q8VBZ3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Clptm1Q8VBZ3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Clptm1Q8VBZ3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Clptm1Q8VBZ3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Clptm1Q8VBZ3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Clptm1Q8VBZ3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Clptm1Q8VBZ3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Clptm1Q8VBZ3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Clptm1Q8VBZ3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Clptm1Q8VBZ3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Clptm1Q8VBZ3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Clptm1Q8VBZ3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Clptm1Q8VBZ3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Clptm1Q8VBZ3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Clptm1Q8VBZ3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Clptm1Q8VBZ3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Clptm1Q8VBZ3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Clptm1Q8VBZ3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Clptm1Q8VBZ3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Clptm1Q8VBZ3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Clptm1Q8VBZ3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Clptm1Q8VBZ3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Clptm1Q8VBZ3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Clptm1Q8VBZ3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Clptm1Q8VBZ3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Clptm1Q8VBZ3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Clptm1Q8VBZ3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Clptm1Q8VBZ3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Clptm1Q8VBZ3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Clptm1Q8VBZ3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Clptm1Q8VBZ3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Clptm1Q8VBZ3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Clptm1Q8VBZ3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Clptm1Q8VBZ3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Clptm1Q8VBZ3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Clptm1Q8VBZ3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Clptm1Q8VBZ3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Clptm1Q8VBZ3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Clptm1Q8VBZ3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Clptm1Q8VBZ3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Clptm1Q8VBZ3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Clptm1Q8VBZ3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Clptm1Q8VBZ3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Clptm1Q8VBZ3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Clptm1Q8VBZ3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Clptm1Q8VBZ3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Clptm1Q8VBZ3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Clptm1Q8VBZ3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Clptm1Q8VBZ3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Clptm1Q8VBZ3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Clptm1Q8VBZ3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Clptm1Q8VBZ3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Clptm1Q8VBZ3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Clptm1Q8VBZ3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Clptm1Q8VBZ3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Clptm1Q8VBZ3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Clptm1Q8VBZ3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Clptm1Q8VBZ3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Clptm1Q8VBZ3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clptm1Q8VBZ3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Clptm1Q8VBZ3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Clptm1Q8VBZ3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Clptm1Q8VBZ3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Clptm1Q8VBZ3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Clptm1Q8VBZ3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Clptm1Q8VBZ3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Clptm1Q8VBZ3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Clptm1Q8VBZ3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Clptm1Q8VBZ3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Clptm1Q8VBZ3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Clptm1Q8VBZ3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Clptm1Q8VBZ3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Clptm1Q8VBZ3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Clptm1Q8VBZ3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Clptm1Q8VBZ3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Clptm1Q8VBZ3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clptm1Q8VBZ3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clptm1Q8VBZ3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Clptm1Q8VBZ3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Clptm1Q8VBZ3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Clptm1Q8VBZ3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Clptm1Q8VBZ3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Clptm1Q8VBZ3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Clptm1Q8VBZ3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Clptm1Q8VBZ3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Clptm1Q8VBZ3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clptm1Q8VBZ3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clptm1Q8VBZ3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clptm1Q8VBZ3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Clptm1Q8VBZ3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Clptm1Q8VBZ3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Clptm1Q8VBZ3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Clptm1Q8VBZ3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Clptm1Q8VBZ3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Clptm1Q8VBZ3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Clptm1Q8VBZ3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Clptm1Q8VBZ3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Clptm1Q8VBZ3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 217.2 ms