Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCQ1

MARCH1, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH1Q8TCQ1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCH1Q8TCQ1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCH1Q8TCQ1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARCH1Q8TCQ1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCH1Q8TCQ1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MARCH1Q8TCQ1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARCH1Q8TCQ1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCH1Q8TCQ1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCH1Q8TCQ1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCH1Q8TCQ1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCH1Q8TCQ1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCH1Q8TCQ1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCH1Q8TCQ1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCH1Q8TCQ1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCH1Q8TCQ1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCH1Q8TCQ1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCH1Q8TCQ1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCH1Q8TCQ1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARCH1Q8TCQ1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARCH1Q8TCQ1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARCH1Q8TCQ1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCH1Q8TCQ1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH1Q8TCQ1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH1Q8TCQ1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH1Q8TCQ1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCH1Q8TCQ1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MARCH1Q8TCQ1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MARCH1Q8TCQ1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MARCH1Q8TCQ1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCH1Q8TCQ1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCH1Q8TCQ1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCH1Q8TCQ1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCH1Q8TCQ1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCH1Q8TCQ1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCH1Q8TCQ1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCH1Q8TCQ1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MARCH1Q8TCQ1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MARCH1Q8TCQ1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MARCH1Q8TCQ1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MARCH1Q8TCQ1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCH1Q8TCQ1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MARCH1Q8TCQ1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MARCH1Q8TCQ1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCH1Q8TCQ1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCH1Q8TCQ1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCH1Q8TCQ1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MARCH1Q8TCQ1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MARCH1Q8TCQ1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MARCH1Q8TCQ1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MARCH1Q8TCQ1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MARCH1Q8TCQ1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MARCH1Q8TCQ1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MARCH1Q8TCQ1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MARCH1Q8TCQ1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MARCH1Q8TCQ1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MARCH1Q8TCQ1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MARCH1Q8TCQ1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCH1Q8TCQ1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCH1Q8TCQ1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MARCH1Q8TCQ1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCH1Q8TCQ1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCH1Q8TCQ1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCH1Q8TCQ1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCH1Q8TCQ1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCH1Q8TCQ1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCH1Q8TCQ1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCH1Q8TCQ1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCH1Q8TCQ1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCH1Q8TCQ1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCH1Q8TCQ1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCH1Q8TCQ1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCH1Q8TCQ1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARCH1Q8TCQ1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH1Q8TCQ1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARCH1Q8TCQ1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARCH1Q8TCQ1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCH1Q8TCQ1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MARCH1Q8TCQ1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MARCH1Q8TCQ1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MARCH1Q8TCQ1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCH1Q8TCQ1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCH1Q8TCQ1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCH1Q8TCQ1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCH1Q8TCQ1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCH1Q8TCQ1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARCH1Q8TCQ1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCH1Q8TCQ1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCH1Q8TCQ1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCH1Q8TCQ1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH1Q8TCQ1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH1Q8TCQ1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH1Q8TCQ1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH1Q8TCQ1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH1Q8TCQ1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH1Q8TCQ1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH1Q8TCQ1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MARCH1Q8TCQ1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MARCH1Q8TCQ1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARCH1Q8TCQ1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARCH1Q8TCQ1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.2 ms