Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI29

FBXO27, F-box only protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO27Q8NI29 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FBXO27Q8NI29 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FBXO27Q8NI29 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FBXO27Q8NI29 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FBXO27Q8NI29 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FBXO27Q8NI29 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FBXO27Q8NI29 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FBXO27Q8NI29 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FBXO27Q8NI29 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FBXO27Q8NI29 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FBXO27Q8NI29 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FBXO27Q8NI29 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FBXO27Q8NI29 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FBXO27Q8NI29 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FBXO27Q8NI29 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FBXO27Q8NI29 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FBXO27Q8NI29 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FBXO27Q8NI29 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FBXO27Q8NI29 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
FBXO27Q8NI29 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FBXO27Q8NI29 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FBXO27Q8NI29 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FBXO27Q8NI29 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FBXO27Q8NI29 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FBXO27Q8NI29 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FBXO27Q8NI29 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FBXO27Q8NI29 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FBXO27Q8NI29 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FBXO27Q8NI29 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FBXO27Q8NI29 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
FBXO27Q8NI29 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FBXO27Q8NI29 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FBXO27Q8NI29 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FBXO27Q8NI29 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FBXO27Q8NI29 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FBXO27Q8NI29 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FBXO27Q8NI29 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FBXO27Q8NI29 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FBXO27Q8NI29 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FBXO27Q8NI29 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FBXO27Q8NI29 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FBXO27Q8NI29 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FBXO27Q8NI29 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FBXO27Q8NI29 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FBXO27Q8NI29 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FBXO27Q8NI29 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FBXO27Q8NI29 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FBXO27Q8NI29 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FBXO27Q8NI29 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FBXO27Q8NI29 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FBXO27Q8NI29 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FBXO27Q8NI29 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FBXO27Q8NI29 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FBXO27Q8NI29 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FBXO27Q8NI29 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FBXO27Q8NI29 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FBXO27Q8NI29 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FBXO27Q8NI29 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FBXO27Q8NI29 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FBXO27Q8NI29 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FBXO27Q8NI29 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FBXO27Q8NI29 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FBXO27Q8NI29 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FBXO27Q8NI29 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FBXO27Q8NI29 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FBXO27Q8NI29 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FBXO27Q8NI29 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FBXO27Q8NI29 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FBXO27Q8NI29 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FBXO27Q8NI29 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FBXO27Q8NI29 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FBXO27Q8NI29 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FBXO27Q8NI29 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FBXO27Q8NI29 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FBXO27Q8NI29 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FBXO27Q8NI29 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FBXO27Q8NI29 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FBXO27Q8NI29 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FBXO27Q8NI29 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FBXO27Q8NI29 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FBXO27Q8NI29 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FBXO27Q8NI29 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FBXO27Q8NI29 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FBXO27Q8NI29 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FBXO27Q8NI29 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FBXO27Q8NI29 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FBXO27Q8NI29 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FBXO27Q8NI29 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FBXO27Q8NI29 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FBXO27Q8NI29 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FBXO27Q8NI29 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FBXO27Q8NI29 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FBXO27Q8NI29 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FBXO27Q8NI29 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FBXO27Q8NI29 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FBXO27Q8NI29 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FBXO27Q8NI29 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FBXO27Q8NI29 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FBXO27Q8NI29 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FBXO27Q8NI29 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms