Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHU3

SGMS2, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS2Q8NHU3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGMS2Q8NHU3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGMS2Q8NHU3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGMS2Q8NHU3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGMS2Q8NHU3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGMS2Q8NHU3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGMS2Q8NHU3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGMS2Q8NHU3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGMS2Q8NHU3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGMS2Q8NHU3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGMS2Q8NHU3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGMS2Q8NHU3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGMS2Q8NHU3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGMS2Q8NHU3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGMS2Q8NHU3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGMS2Q8NHU3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGMS2Q8NHU3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGMS2Q8NHU3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGMS2Q8NHU3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGMS2Q8NHU3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGMS2Q8NHU3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGMS2Q8NHU3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SGMS2Q8NHU3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGMS2Q8NHU3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGMS2Q8NHU3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGMS2Q8NHU3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGMS2Q8NHU3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGMS2Q8NHU3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGMS2Q8NHU3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGMS2Q8NHU3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGMS2Q8NHU3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGMS2Q8NHU3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGMS2Q8NHU3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGMS2Q8NHU3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGMS2Q8NHU3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGMS2Q8NHU3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGMS2Q8NHU3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGMS2Q8NHU3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGMS2Q8NHU3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGMS2Q8NHU3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGMS2Q8NHU3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGMS2Q8NHU3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGMS2Q8NHU3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGMS2Q8NHU3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGMS2Q8NHU3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGMS2Q8NHU3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGMS2Q8NHU3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGMS2Q8NHU3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SGMS2Q8NHU3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGMS2Q8NHU3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SGMS2Q8NHU3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SGMS2Q8NHU3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGMS2Q8NHU3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGMS2Q8NHU3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGMS2Q8NHU3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGMS2Q8NHU3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGMS2Q8NHU3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGMS2Q8NHU3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGMS2Q8NHU3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGMS2Q8NHU3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGMS2Q8NHU3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGMS2Q8NHU3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SGMS2Q8NHU3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SGMS2Q8NHU3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGMS2Q8NHU3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SGMS2Q8NHU3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGMS2Q8NHU3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGMS2Q8NHU3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SGMS2Q8NHU3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGMS2Q8NHU3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGMS2Q8NHU3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGMS2Q8NHU3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGMS2Q8NHU3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGMS2Q8NHU3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGMS2Q8NHU3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGMS2Q8NHU3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGMS2Q8NHU3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGMS2Q8NHU3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGMS2Q8NHU3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGMS2Q8NHU3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGMS2Q8NHU3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGMS2Q8NHU3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGMS2Q8NHU3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGMS2Q8NHU3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGMS2Q8NHU3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SGMS2Q8NHU3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGMS2Q8NHU3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGMS2Q8NHU3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SGMS2Q8NHU3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SGMS2Q8NHU3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGMS2Q8NHU3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGMS2Q8NHU3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGMS2Q8NHU3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGMS2Q8NHU3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGMS2Q8NHU3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGMS2Q8NHU3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGMS2Q8NHU3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGMS2Q8NHU3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGMS2Q8NHU3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGMS2Q8NHU3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms