Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFK1

GJC3, Gap junction gamma-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC3Q8NFK1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJC3Q8NFK1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJC3Q8NFK1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJC3Q8NFK1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJC3Q8NFK1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJC3Q8NFK1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJC3Q8NFK1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJC3Q8NFK1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJC3Q8NFK1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJC3Q8NFK1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJC3Q8NFK1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJC3Q8NFK1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJC3Q8NFK1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GJC3Q8NFK1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJC3Q8NFK1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJC3Q8NFK1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJC3Q8NFK1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJC3Q8NFK1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJC3Q8NFK1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJC3Q8NFK1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GJC3Q8NFK1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJC3Q8NFK1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJC3Q8NFK1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJC3Q8NFK1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJC3Q8NFK1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GJC3Q8NFK1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJC3Q8NFK1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJC3Q8NFK1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJC3Q8NFK1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJC3Q8NFK1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJC3Q8NFK1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJC3Q8NFK1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJC3Q8NFK1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJC3Q8NFK1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJC3Q8NFK1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJC3Q8NFK1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJC3Q8NFK1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJC3Q8NFK1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJC3Q8NFK1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJC3Q8NFK1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJC3Q8NFK1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJC3Q8NFK1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJC3Q8NFK1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJC3Q8NFK1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJC3Q8NFK1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJC3Q8NFK1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJC3Q8NFK1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJC3Q8NFK1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJC3Q8NFK1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJC3Q8NFK1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJC3Q8NFK1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJC3Q8NFK1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJC3Q8NFK1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJC3Q8NFK1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJC3Q8NFK1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJC3Q8NFK1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJC3Q8NFK1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJC3Q8NFK1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJC3Q8NFK1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJC3Q8NFK1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJC3Q8NFK1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJC3Q8NFK1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJC3Q8NFK1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJC3Q8NFK1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJC3Q8NFK1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJC3Q8NFK1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GJC3Q8NFK1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJC3Q8NFK1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJC3Q8NFK1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJC3Q8NFK1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJC3Q8NFK1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJC3Q8NFK1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJC3Q8NFK1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJC3Q8NFK1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJC3Q8NFK1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJC3Q8NFK1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJC3Q8NFK1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJC3Q8NFK1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJC3Q8NFK1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJC3Q8NFK1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJC3Q8NFK1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJC3Q8NFK1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJC3Q8NFK1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJC3Q8NFK1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJC3Q8NFK1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJC3Q8NFK1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GJC3Q8NFK1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJC3Q8NFK1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJC3Q8NFK1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJC3Q8NFK1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJC3Q8NFK1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJC3Q8NFK1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJC3Q8NFK1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJC3Q8NFK1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GJC3Q8NFK1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJC3Q8NFK1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJC3Q8NFK1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJC3Q8NFK1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJC3Q8NFK1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJC3Q8NFK1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms