Protein–RNA interactions for Protein: Q8NES3

LFNG, Beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase lunatic fringe, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LFNGQ8NES3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LFNGQ8NES3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LFNGQ8NES3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LFNGQ8NES3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LFNGQ8NES3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LFNGQ8NES3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LFNGQ8NES3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LFNGQ8NES3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LFNGQ8NES3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LFNGQ8NES3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LFNGQ8NES3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LFNGQ8NES3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LFNGQ8NES3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LFNGQ8NES3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LFNGQ8NES3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LFNGQ8NES3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LFNGQ8NES3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LFNGQ8NES3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LFNGQ8NES3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LFNGQ8NES3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LFNGQ8NES3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LFNGQ8NES3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LFNGQ8NES3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LFNGQ8NES3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LFNGQ8NES3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LFNGQ8NES3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LFNGQ8NES3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LFNGQ8NES3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LFNGQ8NES3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LFNGQ8NES3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LFNGQ8NES3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LFNGQ8NES3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LFNGQ8NES3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LFNGQ8NES3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LFNGQ8NES3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LFNGQ8NES3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LFNGQ8NES3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LFNGQ8NES3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LFNGQ8NES3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LFNGQ8NES3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LFNGQ8NES3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LFNGQ8NES3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LFNGQ8NES3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LFNGQ8NES3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LFNGQ8NES3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LFNGQ8NES3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LFNGQ8NES3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LFNGQ8NES3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LFNGQ8NES3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LFNGQ8NES3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LFNGQ8NES3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LFNGQ8NES3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LFNGQ8NES3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LFNGQ8NES3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LFNGQ8NES3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LFNGQ8NES3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LFNGQ8NES3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LFNGQ8NES3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LFNGQ8NES3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LFNGQ8NES3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LFNGQ8NES3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LFNGQ8NES3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LFNGQ8NES3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LFNGQ8NES3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LFNGQ8NES3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LFNGQ8NES3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LFNGQ8NES3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LFNGQ8NES3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LFNGQ8NES3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LFNGQ8NES3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LFNGQ8NES3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LFNGQ8NES3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LFNGQ8NES3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LFNGQ8NES3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LFNGQ8NES3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LFNGQ8NES3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LFNGQ8NES3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LFNGQ8NES3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LFNGQ8NES3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LFNGQ8NES3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LFNGQ8NES3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LFNGQ8NES3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LFNGQ8NES3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LFNGQ8NES3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LFNGQ8NES3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LFNGQ8NES3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LFNGQ8NES3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LFNGQ8NES3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LFNGQ8NES3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LFNGQ8NES3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LFNGQ8NES3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LFNGQ8NES3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LFNGQ8NES3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LFNGQ8NES3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LFNGQ8NES3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LFNGQ8NES3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LFNGQ8NES3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LFNGQ8NES3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LFNGQ8NES3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LFNGQ8NES3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms