Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEC5

CATSPER1, Cation channel sperm-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER1Q8NEC5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CATSPER1Q8NEC5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CATSPER1Q8NEC5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CATSPER1Q8NEC5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CATSPER1Q8NEC5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CATSPER1Q8NEC5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CATSPER1Q8NEC5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CATSPER1Q8NEC5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CATSPER1Q8NEC5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CATSPER1Q8NEC5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CATSPER1Q8NEC5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CATSPER1Q8NEC5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CATSPER1Q8NEC5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CATSPER1Q8NEC5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CATSPER1Q8NEC5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CATSPER1Q8NEC5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CATSPER1Q8NEC5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CATSPER1Q8NEC5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CATSPER1Q8NEC5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CATSPER1Q8NEC5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CATSPER1Q8NEC5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CATSPER1Q8NEC5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CATSPER1Q8NEC5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CATSPER1Q8NEC5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CATSPER1Q8NEC5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CATSPER1Q8NEC5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CATSPER1Q8NEC5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CATSPER1Q8NEC5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CATSPER1Q8NEC5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CATSPER1Q8NEC5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CATSPER1Q8NEC5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CATSPER1Q8NEC5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CATSPER1Q8NEC5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CATSPER1Q8NEC5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CATSPER1Q8NEC5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CATSPER1Q8NEC5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CATSPER1Q8NEC5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CATSPER1Q8NEC5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CATSPER1Q8NEC5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CATSPER1Q8NEC5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CATSPER1Q8NEC5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CATSPER1Q8NEC5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CATSPER1Q8NEC5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CATSPER1Q8NEC5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CATSPER1Q8NEC5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CATSPER1Q8NEC5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CATSPER1Q8NEC5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CATSPER1Q8NEC5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CATSPER1Q8NEC5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CATSPER1Q8NEC5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CATSPER1Q8NEC5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CATSPER1Q8NEC5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CATSPER1Q8NEC5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CATSPER1Q8NEC5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CATSPER1Q8NEC5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CATSPER1Q8NEC5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CATSPER1Q8NEC5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CATSPER1Q8NEC5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CATSPER1Q8NEC5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CATSPER1Q8NEC5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CATSPER1Q8NEC5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CATSPER1Q8NEC5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CATSPER1Q8NEC5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CATSPER1Q8NEC5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CATSPER1Q8NEC5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CATSPER1Q8NEC5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CATSPER1Q8NEC5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CATSPER1Q8NEC5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CATSPER1Q8NEC5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CATSPER1Q8NEC5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CATSPER1Q8NEC5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CATSPER1Q8NEC5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CATSPER1Q8NEC5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CATSPER1Q8NEC5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CATSPER1Q8NEC5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CATSPER1Q8NEC5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CATSPER1Q8NEC5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CATSPER1Q8NEC5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CATSPER1Q8NEC5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CATSPER1Q8NEC5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CATSPER1Q8NEC5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CATSPER1Q8NEC5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CATSPER1Q8NEC5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CATSPER1Q8NEC5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CATSPER1Q8NEC5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CATSPER1Q8NEC5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CATSPER1Q8NEC5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CATSPER1Q8NEC5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CATSPER1Q8NEC5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CATSPER1Q8NEC5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CATSPER1Q8NEC5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CATSPER1Q8NEC5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CATSPER1Q8NEC5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CATSPER1Q8NEC5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CATSPER1Q8NEC5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CATSPER1Q8NEC5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CATSPER1Q8NEC5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CATSPER1Q8NEC5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CATSPER1Q8NEC5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CATSPER1Q8NEC5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms