Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC96

NECAP1, Adaptin ear-binding coat-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP1Q8NC96 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NECAP1Q8NC96 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NECAP1Q8NC96 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NECAP1Q8NC96 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NECAP1Q8NC96 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NECAP1Q8NC96 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NECAP1Q8NC96 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NECAP1Q8NC96 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NECAP1Q8NC96 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NECAP1Q8NC96 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NECAP1Q8NC96 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NECAP1Q8NC96 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NECAP1Q8NC96 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NECAP1Q8NC96 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NECAP1Q8NC96 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECAP1Q8NC96 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECAP1Q8NC96 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECAP1Q8NC96 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECAP1Q8NC96 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NECAP1Q8NC96 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECAP1Q8NC96 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECAP1Q8NC96 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECAP1Q8NC96 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECAP1Q8NC96 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECAP1Q8NC96 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECAP1Q8NC96 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NECAP1Q8NC96 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECAP1Q8NC96 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECAP1Q8NC96 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NECAP1Q8NC96 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NECAP1Q8NC96 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NECAP1Q8NC96 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NECAP1Q8NC96 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NECAP1Q8NC96 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NECAP1Q8NC96 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NECAP1Q8NC96 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NECAP1Q8NC96 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NECAP1Q8NC96 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NECAP1Q8NC96 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NECAP1Q8NC96 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NECAP1Q8NC96 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NECAP1Q8NC96 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NECAP1Q8NC96 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NECAP1Q8NC96 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NECAP1Q8NC96 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NECAP1Q8NC96 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NECAP1Q8NC96 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NECAP1Q8NC96 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NECAP1Q8NC96 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NECAP1Q8NC96 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NECAP1Q8NC96 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NECAP1Q8NC96 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NECAP1Q8NC96 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NECAP1Q8NC96 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NECAP1Q8NC96 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NECAP1Q8NC96 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NECAP1Q8NC96 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NECAP1Q8NC96 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NECAP1Q8NC96 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NECAP1Q8NC96 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NECAP1Q8NC96 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NECAP1Q8NC96 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NECAP1Q8NC96 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NECAP1Q8NC96 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NECAP1Q8NC96 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NECAP1Q8NC96 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NECAP1Q8NC96 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NECAP1Q8NC96 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NECAP1Q8NC96 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NECAP1Q8NC96 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NECAP1Q8NC96 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NECAP1Q8NC96 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NECAP1Q8NC96 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NECAP1Q8NC96 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NECAP1Q8NC96 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NECAP1Q8NC96 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NECAP1Q8NC96 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECAP1Q8NC96 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECAP1Q8NC96 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECAP1Q8NC96 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NECAP1Q8NC96 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NECAP1Q8NC96 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NECAP1Q8NC96 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NECAP1Q8NC96 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NECAP1Q8NC96 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NECAP1Q8NC96 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NECAP1Q8NC96 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NECAP1Q8NC96 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NECAP1Q8NC96 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NECAP1Q8NC96 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NECAP1Q8NC96 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NECAP1Q8NC96 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NECAP1Q8NC96 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NECAP1Q8NC96 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NECAP1Q8NC96 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NECAP1Q8NC96 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NECAP1Q8NC96 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NECAP1Q8NC96 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NECAP1Q8NC96 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NECAP1Q8NC96 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms