Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Q1

FAM71E2, Protein FAM71E2, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71E2Q8N5Q1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM71E2Q8N5Q1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM71E2Q8N5Q1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM71E2Q8N5Q1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM71E2Q8N5Q1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM71E2Q8N5Q1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM71E2Q8N5Q1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM71E2Q8N5Q1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM71E2Q8N5Q1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM71E2Q8N5Q1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM71E2Q8N5Q1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM71E2Q8N5Q1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM71E2Q8N5Q1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM71E2Q8N5Q1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM71E2Q8N5Q1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM71E2Q8N5Q1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM71E2Q8N5Q1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM71E2Q8N5Q1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM71E2Q8N5Q1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM71E2Q8N5Q1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM71E2Q8N5Q1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM71E2Q8N5Q1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM71E2Q8N5Q1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM71E2Q8N5Q1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM71E2Q8N5Q1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM71E2Q8N5Q1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM71E2Q8N5Q1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM71E2Q8N5Q1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM71E2Q8N5Q1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM71E2Q8N5Q1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM71E2Q8N5Q1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM71E2Q8N5Q1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM71E2Q8N5Q1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM71E2Q8N5Q1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM71E2Q8N5Q1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM71E2Q8N5Q1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM71E2Q8N5Q1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM71E2Q8N5Q1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM71E2Q8N5Q1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM71E2Q8N5Q1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM71E2Q8N5Q1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM71E2Q8N5Q1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM71E2Q8N5Q1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM71E2Q8N5Q1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM71E2Q8N5Q1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM71E2Q8N5Q1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM71E2Q8N5Q1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM71E2Q8N5Q1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM71E2Q8N5Q1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM71E2Q8N5Q1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM71E2Q8N5Q1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM71E2Q8N5Q1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM71E2Q8N5Q1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM71E2Q8N5Q1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM71E2Q8N5Q1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM71E2Q8N5Q1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM71E2Q8N5Q1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM71E2Q8N5Q1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM71E2Q8N5Q1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM71E2Q8N5Q1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM71E2Q8N5Q1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM71E2Q8N5Q1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM71E2Q8N5Q1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM71E2Q8N5Q1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM71E2Q8N5Q1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM71E2Q8N5Q1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM71E2Q8N5Q1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM71E2Q8N5Q1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM71E2Q8N5Q1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM71E2Q8N5Q1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM71E2Q8N5Q1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM71E2Q8N5Q1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM71E2Q8N5Q1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM71E2Q8N5Q1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM71E2Q8N5Q1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM71E2Q8N5Q1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM71E2Q8N5Q1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM71E2Q8N5Q1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM71E2Q8N5Q1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM71E2Q8N5Q1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM71E2Q8N5Q1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM71E2Q8N5Q1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM71E2Q8N5Q1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM71E2Q8N5Q1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM71E2Q8N5Q1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM71E2Q8N5Q1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM71E2Q8N5Q1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM71E2Q8N5Q1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM71E2Q8N5Q1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM71E2Q8N5Q1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM71E2Q8N5Q1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM71E2Q8N5Q1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM71E2Q8N5Q1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM71E2Q8N5Q1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM71E2Q8N5Q1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM71E2Q8N5Q1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM71E2Q8N5Q1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM71E2Q8N5Q1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM71E2Q8N5Q1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM71E2Q8N5Q1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms