Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5J4

SPIC, Transcription factor Spi-C, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPICQ8N5J4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPICQ8N5J4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SPICQ8N5J4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPICQ8N5J4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPICQ8N5J4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPICQ8N5J4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPICQ8N5J4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPICQ8N5J4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPICQ8N5J4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPICQ8N5J4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPICQ8N5J4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPICQ8N5J4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPICQ8N5J4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SPICQ8N5J4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPICQ8N5J4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPICQ8N5J4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPICQ8N5J4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPICQ8N5J4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPICQ8N5J4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPICQ8N5J4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPICQ8N5J4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPICQ8N5J4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPICQ8N5J4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPICQ8N5J4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPICQ8N5J4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPICQ8N5J4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPICQ8N5J4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPICQ8N5J4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPICQ8N5J4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPICQ8N5J4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPICQ8N5J4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPICQ8N5J4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPICQ8N5J4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPICQ8N5J4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPICQ8N5J4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPICQ8N5J4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPICQ8N5J4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPICQ8N5J4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPICQ8N5J4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPICQ8N5J4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPICQ8N5J4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPICQ8N5J4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPICQ8N5J4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPICQ8N5J4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPICQ8N5J4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPICQ8N5J4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPICQ8N5J4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPICQ8N5J4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPICQ8N5J4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPICQ8N5J4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPICQ8N5J4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPICQ8N5J4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPICQ8N5J4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SPICQ8N5J4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPICQ8N5J4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPICQ8N5J4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPICQ8N5J4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPICQ8N5J4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPICQ8N5J4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPICQ8N5J4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPICQ8N5J4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPICQ8N5J4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPICQ8N5J4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPICQ8N5J4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPICQ8N5J4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPICQ8N5J4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPICQ8N5J4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPICQ8N5J4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPICQ8N5J4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPICQ8N5J4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPICQ8N5J4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPICQ8N5J4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPICQ8N5J4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPICQ8N5J4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPICQ8N5J4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPICQ8N5J4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPICQ8N5J4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPICQ8N5J4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPICQ8N5J4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPICQ8N5J4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPICQ8N5J4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPICQ8N5J4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPICQ8N5J4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPICQ8N5J4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPICQ8N5J4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPICQ8N5J4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPICQ8N5J4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPICQ8N5J4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPICQ8N5J4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPICQ8N5J4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPICQ8N5J4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPICQ8N5J4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPICQ8N5J4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPICQ8N5J4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPICQ8N5J4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SPICQ8N5J4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPICQ8N5J4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPICQ8N5J4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPICQ8N5J4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPICQ8N5J4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms