Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q7

Brox, BRO1 domain-containing protein BROX, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BroxQ8K2Q7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BroxQ8K2Q7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BroxQ8K2Q7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BroxQ8K2Q7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BroxQ8K2Q7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BroxQ8K2Q7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BroxQ8K2Q7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
BroxQ8K2Q7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
BroxQ8K2Q7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BroxQ8K2Q7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BroxQ8K2Q7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BroxQ8K2Q7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
BroxQ8K2Q7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BroxQ8K2Q7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BroxQ8K2Q7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BroxQ8K2Q7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BroxQ8K2Q7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BroxQ8K2Q7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BroxQ8K2Q7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BroxQ8K2Q7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BroxQ8K2Q7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BroxQ8K2Q7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BroxQ8K2Q7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BroxQ8K2Q7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BroxQ8K2Q7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BroxQ8K2Q7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BroxQ8K2Q7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BroxQ8K2Q7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BroxQ8K2Q7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BroxQ8K2Q7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BroxQ8K2Q7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BroxQ8K2Q7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BroxQ8K2Q7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BroxQ8K2Q7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
BroxQ8K2Q7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BroxQ8K2Q7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BroxQ8K2Q7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BroxQ8K2Q7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BroxQ8K2Q7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BroxQ8K2Q7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BroxQ8K2Q7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BroxQ8K2Q7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
BroxQ8K2Q7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BroxQ8K2Q7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BroxQ8K2Q7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BroxQ8K2Q7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BroxQ8K2Q7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BroxQ8K2Q7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BroxQ8K2Q7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BroxQ8K2Q7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BroxQ8K2Q7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BroxQ8K2Q7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BroxQ8K2Q7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BroxQ8K2Q7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BroxQ8K2Q7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
BroxQ8K2Q7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BroxQ8K2Q7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BroxQ8K2Q7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BroxQ8K2Q7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BroxQ8K2Q7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BroxQ8K2Q7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BroxQ8K2Q7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BroxQ8K2Q7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BroxQ8K2Q7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
BroxQ8K2Q7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BroxQ8K2Q7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BroxQ8K2Q7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BroxQ8K2Q7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BroxQ8K2Q7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BroxQ8K2Q7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BroxQ8K2Q7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BroxQ8K2Q7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BroxQ8K2Q7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BroxQ8K2Q7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BroxQ8K2Q7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BroxQ8K2Q7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BroxQ8K2Q7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BroxQ8K2Q7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BroxQ8K2Q7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BroxQ8K2Q7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
BroxQ8K2Q7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BroxQ8K2Q7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BroxQ8K2Q7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BroxQ8K2Q7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BroxQ8K2Q7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BroxQ8K2Q7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BroxQ8K2Q7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BroxQ8K2Q7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BroxQ8K2Q7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BroxQ8K2Q7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BroxQ8K2Q7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
BroxQ8K2Q7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BroxQ8K2Q7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BroxQ8K2Q7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
BroxQ8K2Q7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BroxQ8K2Q7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BroxQ8K2Q7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BroxQ8K2Q7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
BroxQ8K2Q7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BroxQ8K2Q7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms