Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2J7

Rell1, RELT-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rell1Q8K2J7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rell1Q8K2J7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rell1Q8K2J7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rell1Q8K2J7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rell1Q8K2J7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rell1Q8K2J7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rell1Q8K2J7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rell1Q8K2J7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Rell1Q8K2J7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rell1Q8K2J7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rell1Q8K2J7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rell1Q8K2J7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rell1Q8K2J7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rell1Q8K2J7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rell1Q8K2J7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rell1Q8K2J7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rell1Q8K2J7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rell1Q8K2J7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Rell1Q8K2J7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rell1Q8K2J7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rell1Q8K2J7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rell1Q8K2J7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Rell1Q8K2J7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rell1Q8K2J7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rell1Q8K2J7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Rell1Q8K2J7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Rell1Q8K2J7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rell1Q8K2J7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rell1Q8K2J7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rell1Q8K2J7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rell1Q8K2J7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rell1Q8K2J7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rell1Q8K2J7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rell1Q8K2J7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rell1Q8K2J7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rell1Q8K2J7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rell1Q8K2J7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rell1Q8K2J7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rell1Q8K2J7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rell1Q8K2J7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rell1Q8K2J7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rell1Q8K2J7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rell1Q8K2J7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rell1Q8K2J7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rell1Q8K2J7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rell1Q8K2J7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rell1Q8K2J7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rell1Q8K2J7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rell1Q8K2J7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rell1Q8K2J7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rell1Q8K2J7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rell1Q8K2J7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rell1Q8K2J7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rell1Q8K2J7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rell1Q8K2J7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rell1Q8K2J7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rell1Q8K2J7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rell1Q8K2J7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rell1Q8K2J7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Rell1Q8K2J7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rell1Q8K2J7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Rell1Q8K2J7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rell1Q8K2J7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rell1Q8K2J7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rell1Q8K2J7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rell1Q8K2J7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rell1Q8K2J7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rell1Q8K2J7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rell1Q8K2J7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rell1Q8K2J7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rell1Q8K2J7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rell1Q8K2J7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rell1Q8K2J7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rell1Q8K2J7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rell1Q8K2J7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rell1Q8K2J7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rell1Q8K2J7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rell1Q8K2J7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rell1Q8K2J7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Rell1Q8K2J7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rell1Q8K2J7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rell1Q8K2J7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rell1Q8K2J7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rell1Q8K2J7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rell1Q8K2J7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Rell1Q8K2J7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rell1Q8K2J7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rell1Q8K2J7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Rell1Q8K2J7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rell1Q8K2J7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rell1Q8K2J7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Rell1Q8K2J7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rell1Q8K2J7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rell1Q8K2J7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rell1Q8K2J7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rell1Q8K2J7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rell1Q8K2J7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rell1Q8K2J7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rell1Q8K2J7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rell1Q8K2J7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms