Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ96

CMTM1, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1Q8IZ96 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CMTM1Q8IZ96 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CMTM1Q8IZ96 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CMTM1Q8IZ96 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CMTM1Q8IZ96 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CMTM1Q8IZ96 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CMTM1Q8IZ96 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CMTM1Q8IZ96 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CMTM1Q8IZ96 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CMTM1Q8IZ96 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CMTM1Q8IZ96 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CMTM1Q8IZ96 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CMTM1Q8IZ96 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CMTM1Q8IZ96 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CMTM1Q8IZ96 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CMTM1Q8IZ96 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CMTM1Q8IZ96 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CMTM1Q8IZ96 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CMTM1Q8IZ96 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CMTM1Q8IZ96 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CMTM1Q8IZ96 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CMTM1Q8IZ96 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CMTM1Q8IZ96 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CMTM1Q8IZ96 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CMTM1Q8IZ96 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CMTM1Q8IZ96 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CMTM1Q8IZ96 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CMTM1Q8IZ96 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CMTM1Q8IZ96 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CMTM1Q8IZ96 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CMTM1Q8IZ96 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CMTM1Q8IZ96 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CMTM1Q8IZ96 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CMTM1Q8IZ96 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CMTM1Q8IZ96 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CMTM1Q8IZ96 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CMTM1Q8IZ96 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CMTM1Q8IZ96 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CMTM1Q8IZ96 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CMTM1Q8IZ96 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CMTM1Q8IZ96 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CMTM1Q8IZ96 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CMTM1Q8IZ96 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CMTM1Q8IZ96 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CMTM1Q8IZ96 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CMTM1Q8IZ96 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CMTM1Q8IZ96 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CMTM1Q8IZ96 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CMTM1Q8IZ96 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CMTM1Q8IZ96 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CMTM1Q8IZ96 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CMTM1Q8IZ96 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMTM1Q8IZ96 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMTM1Q8IZ96 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMTM1Q8IZ96 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CMTM1Q8IZ96 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CMTM1Q8IZ96 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CMTM1Q8IZ96 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CMTM1Q8IZ96 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CMTM1Q8IZ96 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CMTM1Q8IZ96 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CMTM1Q8IZ96 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CMTM1Q8IZ96 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CMTM1Q8IZ96 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CMTM1Q8IZ96 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CMTM1Q8IZ96 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CMTM1Q8IZ96 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CMTM1Q8IZ96 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CMTM1Q8IZ96 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CMTM1Q8IZ96 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CMTM1Q8IZ96 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CMTM1Q8IZ96 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CMTM1Q8IZ96 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CMTM1Q8IZ96 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CMTM1Q8IZ96 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CMTM1Q8IZ96 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CMTM1Q8IZ96 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CMTM1Q8IZ96 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CMTM1Q8IZ96 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CMTM1Q8IZ96 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMTM1Q8IZ96 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMTM1Q8IZ96 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMTM1Q8IZ96 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMTM1Q8IZ96 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CMTM1Q8IZ96 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CMTM1Q8IZ96 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CMTM1Q8IZ96 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CMTM1Q8IZ96 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CMTM1Q8IZ96 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CMTM1Q8IZ96 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CMTM1Q8IZ96 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CMTM1Q8IZ96 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CMTM1Q8IZ96 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CMTM1Q8IZ96 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CMTM1Q8IZ96 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CMTM1Q8IZ96 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMTM1Q8IZ96 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMTM1Q8IZ96 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMTM1Q8IZ96 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CMTM1Q8IZ96 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.7 ms