Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY8

Dctn4, Dynactin subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn4Q8CBY8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dctn4Q8CBY8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dctn4Q8CBY8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dctn4Q8CBY8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dctn4Q8CBY8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dctn4Q8CBY8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dctn4Q8CBY8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dctn4Q8CBY8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dctn4Q8CBY8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dctn4Q8CBY8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dctn4Q8CBY8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dctn4Q8CBY8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dctn4Q8CBY8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dctn4Q8CBY8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dctn4Q8CBY8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dctn4Q8CBY8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dctn4Q8CBY8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dctn4Q8CBY8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dctn4Q8CBY8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dctn4Q8CBY8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dctn4Q8CBY8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Dctn4Q8CBY8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dctn4Q8CBY8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dctn4Q8CBY8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dctn4Q8CBY8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dctn4Q8CBY8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dctn4Q8CBY8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dctn4Q8CBY8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dctn4Q8CBY8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dctn4Q8CBY8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dctn4Q8CBY8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dctn4Q8CBY8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Dctn4Q8CBY8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dctn4Q8CBY8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dctn4Q8CBY8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dctn4Q8CBY8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dctn4Q8CBY8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dctn4Q8CBY8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dctn4Q8CBY8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dctn4Q8CBY8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dctn4Q8CBY8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dctn4Q8CBY8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dctn4Q8CBY8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dctn4Q8CBY8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dctn4Q8CBY8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dctn4Q8CBY8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dctn4Q8CBY8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dctn4Q8CBY8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dctn4Q8CBY8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Dctn4Q8CBY8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dctn4Q8CBY8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dctn4Q8CBY8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dctn4Q8CBY8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dctn4Q8CBY8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dctn4Q8CBY8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dctn4Q8CBY8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dctn4Q8CBY8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dctn4Q8CBY8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dctn4Q8CBY8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dctn4Q8CBY8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dctn4Q8CBY8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dctn4Q8CBY8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dctn4Q8CBY8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Dctn4Q8CBY8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dctn4Q8CBY8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dctn4Q8CBY8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dctn4Q8CBY8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dctn4Q8CBY8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dctn4Q8CBY8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dctn4Q8CBY8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dctn4Q8CBY8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dctn4Q8CBY8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dctn4Q8CBY8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dctn4Q8CBY8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dctn4Q8CBY8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Dctn4Q8CBY8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Dctn4Q8CBY8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Dctn4Q8CBY8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dctn4Q8CBY8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dctn4Q8CBY8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dctn4Q8CBY8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dctn4Q8CBY8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Dctn4Q8CBY8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dctn4Q8CBY8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dctn4Q8CBY8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dctn4Q8CBY8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dctn4Q8CBY8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dctn4Q8CBY8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dctn4Q8CBY8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Dctn4Q8CBY8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Dctn4Q8CBY8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dctn4Q8CBY8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dctn4Q8CBY8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dctn4Q8CBY8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dctn4Q8CBY8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dctn4Q8CBY8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dctn4Q8CBY8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dctn4Q8CBY8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dctn4Q8CBY8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dctn4Q8CBY8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms