Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Usp20Q8C6M1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Usp20Q8C6M1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Usp20Q8C6M1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Usp20Q8C6M1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Usp20Q8C6M1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Usp20Q8C6M1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Usp20Q8C6M1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Usp20Q8C6M1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Usp20Q8C6M1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Usp20Q8C6M1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Usp20Q8C6M1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Usp20Q8C6M1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Usp20Q8C6M1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Usp20Q8C6M1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Usp20Q8C6M1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Usp20Q8C6M1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Usp20Q8C6M1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Usp20Q8C6M1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Usp20Q8C6M1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Usp20Q8C6M1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Usp20Q8C6M1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Usp20Q8C6M1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Usp20Q8C6M1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Usp20Q8C6M1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Usp20Q8C6M1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Usp20Q8C6M1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Usp20Q8C6M1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Usp20Q8C6M1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Usp20Q8C6M1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Usp20Q8C6M1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Usp20Q8C6M1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Usp20Q8C6M1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Usp20Q8C6M1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Usp20Q8C6M1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Usp20Q8C6M1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Usp20Q8C6M1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Usp20Q8C6M1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Usp20Q8C6M1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Usp20Q8C6M1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Usp20Q8C6M1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Usp20Q8C6M1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Usp20Q8C6M1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Usp20Q8C6M1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Usp20Q8C6M1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Usp20Q8C6M1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Usp20Q8C6M1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Usp20Q8C6M1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Usp20Q8C6M1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Usp20Q8C6M1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Usp20Q8C6M1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Usp20Q8C6M1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Usp20Q8C6M1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Usp20Q8C6M1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Usp20Q8C6M1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Usp20Q8C6M1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Usp20Q8C6M1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Usp20Q8C6M1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Usp20Q8C6M1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Usp20Q8C6M1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Usp20Q8C6M1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Usp20Q8C6M1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Usp20Q8C6M1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Usp20Q8C6M1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Usp20Q8C6M1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Usp20Q8C6M1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Usp20Q8C6M1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Usp20Q8C6M1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Usp20Q8C6M1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Usp20Q8C6M1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Usp20Q8C6M1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Usp20Q8C6M1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Usp20Q8C6M1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Usp20Q8C6M1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Usp20Q8C6M1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Usp20Q8C6M1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Usp20Q8C6M1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Usp20Q8C6M1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Usp20Q8C6M1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Usp20Q8C6M1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Usp20Q8C6M1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Usp20Q8C6M1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Usp20Q8C6M1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Usp20Q8C6M1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Usp20Q8C6M1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Usp20Q8C6M1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Usp20Q8C6M1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Usp20Q8C6M1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Usp20Q8C6M1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Usp20Q8C6M1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Usp20Q8C6M1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Usp20Q8C6M1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Usp20Q8C6M1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Usp20Q8C6M1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
Usp20Q8C6M1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Usp20Q8C6M1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Usp20Q8C6M1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Usp20Q8C6M1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Usp20Q8C6M1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Usp20Q8C6M1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
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