Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ctdsp2Q8BX07 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ctdsp2Q8BX07 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ctdsp2Q8BX07 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ctdsp2Q8BX07 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ctdsp2Q8BX07 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ctdsp2Q8BX07 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctdsp2Q8BX07 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctdsp2Q8BX07 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ctdsp2Q8BX07 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ctdsp2Q8BX07 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ctdsp2Q8BX07 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ctdsp2Q8BX07 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ctdsp2Q8BX07 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ctdsp2Q8BX07 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ctdsp2Q8BX07 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ctdsp2Q8BX07 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctdsp2Q8BX07 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ctdsp2Q8BX07 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctdsp2Q8BX07 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctdsp2Q8BX07 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctdsp2Q8BX07 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctdsp2Q8BX07 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctdsp2Q8BX07 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ctdsp2Q8BX07 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ctdsp2Q8BX07 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ctdsp2Q8BX07 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ctdsp2Q8BX07 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ctdsp2Q8BX07 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ctdsp2Q8BX07 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ctdsp2Q8BX07 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ctdsp2Q8BX07 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ctdsp2Q8BX07 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctdsp2Q8BX07 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctdsp2Q8BX07 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ctdsp2Q8BX07 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ctdsp2Q8BX07 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ctdsp2Q8BX07 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ctdsp2Q8BX07 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctdsp2Q8BX07 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ctdsp2Q8BX07 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ctdsp2Q8BX07 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ctdsp2Q8BX07 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ctdsp2Q8BX07 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ctdsp2Q8BX07 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ctdsp2Q8BX07 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ctdsp2Q8BX07 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ctdsp2Q8BX07 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ctdsp2Q8BX07 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ctdsp2Q8BX07 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ctdsp2Q8BX07 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ctdsp2Q8BX07 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ctdsp2Q8BX07 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctdsp2Q8BX07 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ctdsp2Q8BX07 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ctdsp2Q8BX07 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ctdsp2Q8BX07 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ctdsp2Q8BX07 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ctdsp2Q8BX07 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ctdsp2Q8BX07 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ctdsp2Q8BX07 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctdsp2Q8BX07 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctdsp2Q8BX07 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctdsp2Q8BX07 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctdsp2Q8BX07 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ctdsp2Q8BX07 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ctdsp2Q8BX07 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ctdsp2Q8BX07 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ctdsp2Q8BX07 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ctdsp2Q8BX07 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctdsp2Q8BX07 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctdsp2Q8BX07 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ctdsp2Q8BX07 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctdsp2Q8BX07 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctdsp2Q8BX07 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctdsp2Q8BX07 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctdsp2Q8BX07 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctdsp2Q8BX07 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ctdsp2Q8BX07 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ctdsp2Q8BX07 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ctdsp2Q8BX07 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctdsp2Q8BX07 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctdsp2Q8BX07 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctdsp2Q8BX07 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctdsp2Q8BX07 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctdsp2Q8BX07 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctdsp2Q8BX07 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ctdsp2Q8BX07 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctdsp2Q8BX07 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctdsp2Q8BX07 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctdsp2Q8BX07 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ctdsp2Q8BX07 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ctdsp2Q8BX07 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ctdsp2Q8BX07 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctdsp2Q8BX07 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctdsp2Q8BX07 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctdsp2Q8BX07 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctdsp2Q8BX07 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctdsp2Q8BX07 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
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