Protein–RNA interactions for Protein: Q86YD5

LDLRAD3, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD3Q86YD5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LDLRAD3Q86YD5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LDLRAD3Q86YD5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LDLRAD3Q86YD5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LDLRAD3Q86YD5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LDLRAD3Q86YD5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LDLRAD3Q86YD5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LDLRAD3Q86YD5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDLRAD3Q86YD5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDLRAD3Q86YD5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDLRAD3Q86YD5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LDLRAD3Q86YD5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LDLRAD3Q86YD5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LDLRAD3Q86YD5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LDLRAD3Q86YD5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LDLRAD3Q86YD5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LDLRAD3Q86YD5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LDLRAD3Q86YD5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LDLRAD3Q86YD5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LDLRAD3Q86YD5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LDLRAD3Q86YD5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LDLRAD3Q86YD5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LDLRAD3Q86YD5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDLRAD3Q86YD5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LDLRAD3Q86YD5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LDLRAD3Q86YD5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LDLRAD3Q86YD5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LDLRAD3Q86YD5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDLRAD3Q86YD5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDLRAD3Q86YD5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LDLRAD3Q86YD5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LDLRAD3Q86YD5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LDLRAD3Q86YD5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LDLRAD3Q86YD5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LDLRAD3Q86YD5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LDLRAD3Q86YD5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LDLRAD3Q86YD5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LDLRAD3Q86YD5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LDLRAD3Q86YD5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LDLRAD3Q86YD5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LDLRAD3Q86YD5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LDLRAD3Q86YD5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LDLRAD3Q86YD5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LDLRAD3Q86YD5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LDLRAD3Q86YD5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LDLRAD3Q86YD5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LDLRAD3Q86YD5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LDLRAD3Q86YD5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LDLRAD3Q86YD5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LDLRAD3Q86YD5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LDLRAD3Q86YD5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LDLRAD3Q86YD5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LDLRAD3Q86YD5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LDLRAD3Q86YD5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LDLRAD3Q86YD5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LDLRAD3Q86YD5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LDLRAD3Q86YD5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LDLRAD3Q86YD5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDLRAD3Q86YD5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDLRAD3Q86YD5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LDLRAD3Q86YD5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LDLRAD3Q86YD5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LDLRAD3Q86YD5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LDLRAD3Q86YD5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LDLRAD3Q86YD5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDLRAD3Q86YD5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDLRAD3Q86YD5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LDLRAD3Q86YD5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LDLRAD3Q86YD5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LDLRAD3Q86YD5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LDLRAD3Q86YD5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LDLRAD3Q86YD5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LDLRAD3Q86YD5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDLRAD3Q86YD5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDLRAD3Q86YD5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDLRAD3Q86YD5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDLRAD3Q86YD5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDLRAD3Q86YD5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDLRAD3Q86YD5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LDLRAD3Q86YD5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDLRAD3Q86YD5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDLRAD3Q86YD5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDLRAD3Q86YD5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDLRAD3Q86YD5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDLRAD3Q86YD5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LDLRAD3Q86YD5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LDLRAD3Q86YD5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LDLRAD3Q86YD5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LDLRAD3Q86YD5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LDLRAD3Q86YD5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LDLRAD3Q86YD5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LDLRAD3Q86YD5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LDLRAD3Q86YD5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LDLRAD3Q86YD5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LDLRAD3Q86YD5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LDLRAD3Q86YD5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LDLRAD3Q86YD5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LDLRAD3Q86YD5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LDLRAD3Q86YD5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LDLRAD3Q86YD5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms