Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSX7Q7RTT5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSX7Q7RTT5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSX7Q7RTT5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSX7Q7RTT5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSX7Q7RTT5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSX7Q7RTT5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSX7Q7RTT5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSX7Q7RTT5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSX7Q7RTT5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSX7Q7RTT5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSX7Q7RTT5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSX7Q7RTT5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSX7Q7RTT5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSX7Q7RTT5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSX7Q7RTT5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSX7Q7RTT5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSX7Q7RTT5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSX7Q7RTT5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSX7Q7RTT5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSX7Q7RTT5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX7Q7RTT5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSX7Q7RTT5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSX7Q7RTT5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSX7Q7RTT5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSX7Q7RTT5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSX7Q7RTT5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSX7Q7RTT5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSX7Q7RTT5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSX7Q7RTT5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSX7Q7RTT5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSX7Q7RTT5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSX7Q7RTT5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSX7Q7RTT5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSX7Q7RTT5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSX7Q7RTT5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SSX7Q7RTT5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSX7Q7RTT5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SSX7Q7RTT5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSX7Q7RTT5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSX7Q7RTT5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSX7Q7RTT5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSX7Q7RTT5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSX7Q7RTT5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSX7Q7RTT5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSX7Q7RTT5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSX7Q7RTT5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSX7Q7RTT5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSX7Q7RTT5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSX7Q7RTT5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSX7Q7RTT5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSX7Q7RTT5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSX7Q7RTT5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSX7Q7RTT5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSX7Q7RTT5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SSX7Q7RTT5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSX7Q7RTT5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSX7Q7RTT5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSX7Q7RTT5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSX7Q7RTT5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSX7Q7RTT5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSX7Q7RTT5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSX7Q7RTT5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSX7Q7RTT5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSX7Q7RTT5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSX7Q7RTT5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSX7Q7RTT5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSX7Q7RTT5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSX7Q7RTT5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSX7Q7RTT5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSX7Q7RTT5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSX7Q7RTT5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SSX7Q7RTT5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX7Q7RTT5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX7Q7RTT5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX7Q7RTT5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX7Q7RTT5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSX7Q7RTT5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSX7Q7RTT5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSX7Q7RTT5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSX7Q7RTT5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSX7Q7RTT5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSX7Q7RTT5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSX7Q7RTT5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSX7Q7RTT5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSX7Q7RTT5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSX7Q7RTT5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSX7Q7RTT5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSX7Q7RTT5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSX7Q7RTT5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSX7Q7RTT5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSX7Q7RTT5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSX7Q7RTT5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSX7Q7RTT5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSX7Q7RTT5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSX7Q7RTT5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSX7Q7RTT5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSX7Q7RTT5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SSX7Q7RTT5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SSX7Q7RTT5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms