Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT3

SSX9, Protein SSX9, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX9Q7RTT3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSX9Q7RTT3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSX9Q7RTT3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSX9Q7RTT3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSX9Q7RTT3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSX9Q7RTT3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSX9Q7RTT3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSX9Q7RTT3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSX9Q7RTT3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSX9Q7RTT3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSX9Q7RTT3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSX9Q7RTT3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSX9Q7RTT3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SSX9Q7RTT3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSX9Q7RTT3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSX9Q7RTT3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSX9Q7RTT3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSX9Q7RTT3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSX9Q7RTT3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SSX9Q7RTT3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSX9Q7RTT3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSX9Q7RTT3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSX9Q7RTT3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSX9Q7RTT3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSX9Q7RTT3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSX9Q7RTT3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSX9Q7RTT3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSX9Q7RTT3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSX9Q7RTT3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSX9Q7RTT3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSX9Q7RTT3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSX9Q7RTT3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSX9Q7RTT3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSX9Q7RTT3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSX9Q7RTT3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSX9Q7RTT3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSX9Q7RTT3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSX9Q7RTT3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSX9Q7RTT3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSX9Q7RTT3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSX9Q7RTT3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSX9Q7RTT3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSX9Q7RTT3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSX9Q7RTT3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSX9Q7RTT3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSX9Q7RTT3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSX9Q7RTT3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSX9Q7RTT3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSX9Q7RTT3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSX9Q7RTT3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSX9Q7RTT3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSX9Q7RTT3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSX9Q7RTT3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSX9Q7RTT3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSX9Q7RTT3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSX9Q7RTT3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSX9Q7RTT3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSX9Q7RTT3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSX9Q7RTT3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSX9Q7RTT3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSX9Q7RTT3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSX9Q7RTT3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SSX9Q7RTT3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSX9Q7RTT3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSX9Q7RTT3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SSX9Q7RTT3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSX9Q7RTT3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSX9Q7RTT3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSX9Q7RTT3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSX9Q7RTT3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSX9Q7RTT3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSX9Q7RTT3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSX9Q7RTT3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSX9Q7RTT3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSX9Q7RTT3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSX9Q7RTT3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSX9Q7RTT3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSX9Q7RTT3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSX9Q7RTT3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSX9Q7RTT3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSX9Q7RTT3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSX9Q7RTT3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSX9Q7RTT3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSX9Q7RTT3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSX9Q7RTT3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSX9Q7RTT3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSX9Q7RTT3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSX9Q7RTT3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSX9Q7RTT3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSX9Q7RTT3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSX9Q7RTT3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSX9Q7RTT3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSX9Q7RTT3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSX9Q7RTT3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSX9Q7RTT3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSX9Q7RTT3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSX9Q7RTT3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSX9Q7RTT3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSX9Q7RTT3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSX9Q7RTT3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 381.4 ms