Protein–RNA interactions for Protein: Q7LBR1

CHMP1B, Charged multivesicular body protein 1b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP1BQ7LBR1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHMP1BQ7LBR1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHMP1BQ7LBR1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP1BQ7LBR1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMP1BQ7LBR1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHMP1BQ7LBR1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP1BQ7LBR1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHMP1BQ7LBR1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHMP1BQ7LBR1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHMP1BQ7LBR1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMP1BQ7LBR1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMP1BQ7LBR1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMP1BQ7LBR1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP1BQ7LBR1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP1BQ7LBR1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP1BQ7LBR1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP1BQ7LBR1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHMP1BQ7LBR1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP1BQ7LBR1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP1BQ7LBR1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP1BQ7LBR1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP1BQ7LBR1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP1BQ7LBR1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP1BQ7LBR1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP1BQ7LBR1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHMP1BQ7LBR1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP1BQ7LBR1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP1BQ7LBR1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP1BQ7LBR1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP1BQ7LBR1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP1BQ7LBR1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP1BQ7LBR1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMP1BQ7LBR1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
CHMP1BQ7LBR1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMP1BQ7LBR1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP1BQ7LBR1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP1BQ7LBR1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP1BQ7LBR1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP1BQ7LBR1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP1BQ7LBR1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP1BQ7LBR1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP1BQ7LBR1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP1BQ7LBR1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP1BQ7LBR1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP1BQ7LBR1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP1BQ7LBR1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP1BQ7LBR1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP1BQ7LBR1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP1BQ7LBR1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP1BQ7LBR1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP1BQ7LBR1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP1BQ7LBR1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP1BQ7LBR1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP1BQ7LBR1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMP1BQ7LBR1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHMP1BQ7LBR1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHMP1BQ7LBR1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP1BQ7LBR1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP1BQ7LBR1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMP1BQ7LBR1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMP1BQ7LBR1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP1BQ7LBR1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP1BQ7LBR1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMP1BQ7LBR1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMP1BQ7LBR1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMP1BQ7LBR1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP1BQ7LBR1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP1BQ7LBR1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP1BQ7LBR1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHMP1BQ7LBR1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHMP1BQ7LBR1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHMP1BQ7LBR1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHMP1BQ7LBR1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMP1BQ7LBR1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP1BQ7LBR1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP1BQ7LBR1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP1BQ7LBR1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP1BQ7LBR1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP1BQ7LBR1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP1BQ7LBR1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHMP1BQ7LBR1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHMP1BQ7LBR1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMP1BQ7LBR1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMP1BQ7LBR1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP1BQ7LBR1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP1BQ7LBR1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP1BQ7LBR1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP1BQ7LBR1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP1BQ7LBR1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMP1BQ7LBR1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHMP1BQ7LBR1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHMP1BQ7LBR1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHMP1BQ7LBR1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMP1BQ7LBR1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMP1BQ7LBR1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMP1BQ7LBR1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHMP1BQ7LBR1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMP1BQ7LBR1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP1BQ7LBR1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP1BQ7LBR1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms