Protein–RNA interactions for Protein: Q71U36

TUBA1A, Tubulin alpha-1A chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1AQ71U36 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBA1AQ71U36 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TUBA1AQ71U36 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBA1AQ71U36 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUBA1AQ71U36 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBA1AQ71U36 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBA1AQ71U36 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBA1AQ71U36 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBA1AQ71U36 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBA1AQ71U36 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TUBA1AQ71U36 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBA1AQ71U36 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBA1AQ71U36 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBA1AQ71U36 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBA1AQ71U36 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBA1AQ71U36 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TUBA1AQ71U36 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBA1AQ71U36 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TUBA1AQ71U36 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUBA1AQ71U36 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TUBA1AQ71U36 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TUBA1AQ71U36 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TUBA1AQ71U36 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TUBA1AQ71U36 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TUBA1AQ71U36 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBA1AQ71U36 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBA1AQ71U36 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBA1AQ71U36 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBA1AQ71U36 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBA1AQ71U36 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBA1AQ71U36 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBA1AQ71U36 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TUBA1AQ71U36 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TUBA1AQ71U36 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBA1AQ71U36 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBA1AQ71U36 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBA1AQ71U36 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBA1AQ71U36 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBA1AQ71U36 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBA1AQ71U36 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBA1AQ71U36 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TUBA1AQ71U36 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBA1AQ71U36 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBA1AQ71U36 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBA1AQ71U36 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBA1AQ71U36 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBA1AQ71U36 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBA1AQ71U36 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBA1AQ71U36 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBA1AQ71U36 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBA1AQ71U36 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBA1AQ71U36 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBA1AQ71U36 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBA1AQ71U36 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
TUBA1AQ71U36 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBA1AQ71U36 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBA1AQ71U36 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBA1AQ71U36 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBA1AQ71U36 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBA1AQ71U36 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TUBA1AQ71U36 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBA1AQ71U36 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBA1AQ71U36 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBA1AQ71U36 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBA1AQ71U36 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBA1AQ71U36 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBA1AQ71U36 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBA1AQ71U36 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBA1AQ71U36 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TUBA1AQ71U36 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBA1AQ71U36 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBA1AQ71U36 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBA1AQ71U36 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBA1AQ71U36 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBA1AQ71U36 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBA1AQ71U36 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBA1AQ71U36 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBA1AQ71U36 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBA1AQ71U36 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBA1AQ71U36 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBA1AQ71U36 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBA1AQ71U36 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBA1AQ71U36 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBA1AQ71U36 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBA1AQ71U36 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBA1AQ71U36 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBA1AQ71U36 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBA1AQ71U36 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBA1AQ71U36 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBA1AQ71U36 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBA1AQ71U36 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBA1AQ71U36 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBA1AQ71U36 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBA1AQ71U36 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBA1AQ71U36 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBA1AQ71U36 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBA1AQ71U36 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBA1AQ71U36 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBA1AQ71U36 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBA1AQ71U36 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms