Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU52

KIAA0408, Uncharacterized protein KIAA0408, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0408Q6ZU52 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KIAA0408Q6ZU52 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KIAA0408Q6ZU52 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KIAA0408Q6ZU52 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KIAA0408Q6ZU52 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KIAA0408Q6ZU52 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KIAA0408Q6ZU52 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KIAA0408Q6ZU52 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KIAA0408Q6ZU52 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KIAA0408Q6ZU52 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KIAA0408Q6ZU52 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KIAA0408Q6ZU52 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KIAA0408Q6ZU52 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KIAA0408Q6ZU52 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KIAA0408Q6ZU52 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KIAA0408Q6ZU52 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KIAA0408Q6ZU52 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KIAA0408Q6ZU52 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KIAA0408Q6ZU52 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KIAA0408Q6ZU52 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KIAA0408Q6ZU52 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KIAA0408Q6ZU52 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KIAA0408Q6ZU52 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
KIAA0408Q6ZU52 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KIAA0408Q6ZU52 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KIAA0408Q6ZU52 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KIAA0408Q6ZU52 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KIAA0408Q6ZU52 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KIAA0408Q6ZU52 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KIAA0408Q6ZU52 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KIAA0408Q6ZU52 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KIAA0408Q6ZU52 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KIAA0408Q6ZU52 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KIAA0408Q6ZU52 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KIAA0408Q6ZU52 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KIAA0408Q6ZU52 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KIAA0408Q6ZU52 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIAA0408Q6ZU52 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KIAA0408Q6ZU52 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KIAA0408Q6ZU52 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KIAA0408Q6ZU52 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
KIAA0408Q6ZU52 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KIAA0408Q6ZU52 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KIAA0408Q6ZU52 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KIAA0408Q6ZU52 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIAA0408Q6ZU52 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIAA0408Q6ZU52 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KIAA0408Q6ZU52 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KIAA0408Q6ZU52 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KIAA0408Q6ZU52 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
KIAA0408Q6ZU52 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KIAA0408Q6ZU52 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIAA0408Q6ZU52 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIAA0408Q6ZU52 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIAA0408Q6ZU52 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIAA0408Q6ZU52 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KIAA0408Q6ZU52 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIAA0408Q6ZU52 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIAA0408Q6ZU52 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIAA0408Q6ZU52 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIAA0408Q6ZU52 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIAA0408Q6ZU52 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIAA0408Q6ZU52 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KIAA0408Q6ZU52 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KIAA0408Q6ZU52 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KIAA0408Q6ZU52 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KIAA0408Q6ZU52 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KIAA0408Q6ZU52 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KIAA0408Q6ZU52 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KIAA0408Q6ZU52 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KIAA0408Q6ZU52 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KIAA0408Q6ZU52 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KIAA0408Q6ZU52 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KIAA0408Q6ZU52 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KIAA0408Q6ZU52 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KIAA0408Q6ZU52 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KIAA0408Q6ZU52 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KIAA0408Q6ZU52 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KIAA0408Q6ZU52 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KIAA0408Q6ZU52 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KIAA0408Q6ZU52 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KIAA0408Q6ZU52 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KIAA0408Q6ZU52 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KIAA0408Q6ZU52 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIAA0408Q6ZU52 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KIAA0408Q6ZU52 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KIAA0408Q6ZU52 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KIAA0408Q6ZU52 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KIAA0408Q6ZU52 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KIAA0408Q6ZU52 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KIAA0408Q6ZU52 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KIAA0408Q6ZU52 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KIAA0408Q6ZU52 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KIAA0408Q6ZU52 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KIAA0408Q6ZU52 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KIAA0408Q6ZU52 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KIAA0408Q6ZU52 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KIAA0408Q6ZU52 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KIAA0408Q6ZU52 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KIAA0408Q6ZU52 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms