Protein–RNA interactions for Protein: Q6W3F0

P4ha3, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha3Q6W3F0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
P4ha3Q6W3F0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
P4ha3Q6W3F0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
P4ha3Q6W3F0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
P4ha3Q6W3F0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
P4ha3Q6W3F0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
P4ha3Q6W3F0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
P4ha3Q6W3F0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
P4ha3Q6W3F0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
P4ha3Q6W3F0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
P4ha3Q6W3F0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
P4ha3Q6W3F0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
P4ha3Q6W3F0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
P4ha3Q6W3F0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
P4ha3Q6W3F0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
P4ha3Q6W3F0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
P4ha3Q6W3F0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P4ha3Q6W3F0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
P4ha3Q6W3F0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
P4ha3Q6W3F0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
P4ha3Q6W3F0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
P4ha3Q6W3F0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
P4ha3Q6W3F0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
P4ha3Q6W3F0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
P4ha3Q6W3F0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
P4ha3Q6W3F0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
P4ha3Q6W3F0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
P4ha3Q6W3F0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
P4ha3Q6W3F0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
P4ha3Q6W3F0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
P4ha3Q6W3F0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
P4ha3Q6W3F0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
P4ha3Q6W3F0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
P4ha3Q6W3F0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
P4ha3Q6W3F0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
P4ha3Q6W3F0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
P4ha3Q6W3F0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
P4ha3Q6W3F0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
P4ha3Q6W3F0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
P4ha3Q6W3F0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
P4ha3Q6W3F0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
P4ha3Q6W3F0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
P4ha3Q6W3F0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
P4ha3Q6W3F0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
P4ha3Q6W3F0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
P4ha3Q6W3F0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
P4ha3Q6W3F0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
P4ha3Q6W3F0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
P4ha3Q6W3F0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P4ha3Q6W3F0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
P4ha3Q6W3F0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
P4ha3Q6W3F0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
P4ha3Q6W3F0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
P4ha3Q6W3F0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
P4ha3Q6W3F0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
P4ha3Q6W3F0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
P4ha3Q6W3F0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
P4ha3Q6W3F0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
P4ha3Q6W3F0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
P4ha3Q6W3F0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
P4ha3Q6W3F0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
P4ha3Q6W3F0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
P4ha3Q6W3F0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
P4ha3Q6W3F0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
P4ha3Q6W3F0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
P4ha3Q6W3F0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
P4ha3Q6W3F0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
P4ha3Q6W3F0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
P4ha3Q6W3F0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
P4ha3Q6W3F0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
P4ha3Q6W3F0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
P4ha3Q6W3F0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
P4ha3Q6W3F0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P4ha3Q6W3F0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P4ha3Q6W3F0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
P4ha3Q6W3F0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
P4ha3Q6W3F0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
P4ha3Q6W3F0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
P4ha3Q6W3F0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P4ha3Q6W3F0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
P4ha3Q6W3F0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
P4ha3Q6W3F0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
P4ha3Q6W3F0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
P4ha3Q6W3F0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
P4ha3Q6W3F0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
P4ha3Q6W3F0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
P4ha3Q6W3F0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
P4ha3Q6W3F0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P4ha3Q6W3F0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P4ha3Q6W3F0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P4ha3Q6W3F0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
P4ha3Q6W3F0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P4ha3Q6W3F0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P4ha3Q6W3F0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P4ha3Q6W3F0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
P4ha3Q6W3F0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
P4ha3Q6W3F0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P4ha3Q6W3F0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P4ha3Q6W3F0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P4ha3Q6W3F0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 950.6 ms