Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN8

CLEC9A, C-type lectin domain family 9 member A, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC9AQ6UXN8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLEC9AQ6UXN8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLEC9AQ6UXN8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLEC9AQ6UXN8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLEC9AQ6UXN8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLEC9AQ6UXN8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLEC9AQ6UXN8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLEC9AQ6UXN8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLEC9AQ6UXN8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLEC9AQ6UXN8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLEC9AQ6UXN8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLEC9AQ6UXN8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLEC9AQ6UXN8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLEC9AQ6UXN8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLEC9AQ6UXN8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLEC9AQ6UXN8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLEC9AQ6UXN8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLEC9AQ6UXN8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLEC9AQ6UXN8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLEC9AQ6UXN8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLEC9AQ6UXN8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLEC9AQ6UXN8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLEC9AQ6UXN8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLEC9AQ6UXN8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLEC9AQ6UXN8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLEC9AQ6UXN8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CLEC9AQ6UXN8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLEC9AQ6UXN8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLEC9AQ6UXN8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLEC9AQ6UXN8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLEC9AQ6UXN8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CLEC9AQ6UXN8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLEC9AQ6UXN8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLEC9AQ6UXN8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLEC9AQ6UXN8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLEC9AQ6UXN8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLEC9AQ6UXN8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLEC9AQ6UXN8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLEC9AQ6UXN8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLEC9AQ6UXN8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CLEC9AQ6UXN8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CLEC9AQ6UXN8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLEC9AQ6UXN8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLEC9AQ6UXN8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLEC9AQ6UXN8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLEC9AQ6UXN8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLEC9AQ6UXN8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLEC9AQ6UXN8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLEC9AQ6UXN8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLEC9AQ6UXN8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLEC9AQ6UXN8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLEC9AQ6UXN8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLEC9AQ6UXN8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CLEC9AQ6UXN8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CLEC9AQ6UXN8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLEC9AQ6UXN8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLEC9AQ6UXN8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC9AQ6UXN8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC9AQ6UXN8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC9AQ6UXN8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLEC9AQ6UXN8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLEC9AQ6UXN8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLEC9AQ6UXN8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLEC9AQ6UXN8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLEC9AQ6UXN8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLEC9AQ6UXN8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLEC9AQ6UXN8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLEC9AQ6UXN8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLEC9AQ6UXN8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLEC9AQ6UXN8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLEC9AQ6UXN8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLEC9AQ6UXN8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLEC9AQ6UXN8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLEC9AQ6UXN8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLEC9AQ6UXN8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLEC9AQ6UXN8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLEC9AQ6UXN8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLEC9AQ6UXN8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLEC9AQ6UXN8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLEC9AQ6UXN8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLEC9AQ6UXN8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLEC9AQ6UXN8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLEC9AQ6UXN8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLEC9AQ6UXN8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLEC9AQ6UXN8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLEC9AQ6UXN8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLEC9AQ6UXN8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLEC9AQ6UXN8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLEC9AQ6UXN8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLEC9AQ6UXN8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLEC9AQ6UXN8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLEC9AQ6UXN8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLEC9AQ6UXN8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLEC9AQ6UXN8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLEC9AQ6UXN8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLEC9AQ6UXN8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLEC9AQ6UXN8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLEC9AQ6UXN8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLEC9AQ6UXN8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLEC9AQ6UXN8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms