Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
VSTM1Q6UX27 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
VSTM1Q6UX27 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
VSTM1Q6UX27 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
VSTM1Q6UX27 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
VSTM1Q6UX27 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
VSTM1Q6UX27 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
VSTM1Q6UX27 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
VSTM1Q6UX27 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
VSTM1Q6UX27 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
VSTM1Q6UX27 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
VSTM1Q6UX27 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
VSTM1Q6UX27 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
VSTM1Q6UX27 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
VSTM1Q6UX27 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
VSTM1Q6UX27 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
VSTM1Q6UX27 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
VSTM1Q6UX27 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
VSTM1Q6UX27 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
VSTM1Q6UX27 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
VSTM1Q6UX27 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
VSTM1Q6UX27 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
VSTM1Q6UX27 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
VSTM1Q6UX27 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
VSTM1Q6UX27 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
VSTM1Q6UX27 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
VSTM1Q6UX27 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
VSTM1Q6UX27 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
VSTM1Q6UX27 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
VSTM1Q6UX27 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
VSTM1Q6UX27 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
VSTM1Q6UX27 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
VSTM1Q6UX27 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
VSTM1Q6UX27 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
VSTM1Q6UX27 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
VSTM1Q6UX27 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
VSTM1Q6UX27 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
VSTM1Q6UX27 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
VSTM1Q6UX27 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
VSTM1Q6UX27 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
VSTM1Q6UX27 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
VSTM1Q6UX27 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
VSTM1Q6UX27 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
VSTM1Q6UX27 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
VSTM1Q6UX27 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
VSTM1Q6UX27 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
VSTM1Q6UX27 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
VSTM1Q6UX27 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
VSTM1Q6UX27 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
VSTM1Q6UX27 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
VSTM1Q6UX27 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
VSTM1Q6UX27 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
VSTM1Q6UX27 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
VSTM1Q6UX27 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
VSTM1Q6UX27 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
VSTM1Q6UX27 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
VSTM1Q6UX27 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
VSTM1Q6UX27 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
VSTM1Q6UX27 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
VSTM1Q6UX27 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
VSTM1Q6UX27 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
VSTM1Q6UX27 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
VSTM1Q6UX27 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
VSTM1Q6UX27 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
VSTM1Q6UX27 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
VSTM1Q6UX27 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
VSTM1Q6UX27 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
VSTM1Q6UX27 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
VSTM1Q6UX27 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
VSTM1Q6UX27 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
VSTM1Q6UX27 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
VSTM1Q6UX27 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
VSTM1Q6UX27 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
VSTM1Q6UX27 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
VSTM1Q6UX27 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
VSTM1Q6UX27 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
VSTM1Q6UX27 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
VSTM1Q6UX27 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
VSTM1Q6UX27 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
VSTM1Q6UX27 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
VSTM1Q6UX27 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
VSTM1Q6UX27 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
VSTM1Q6UX27 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
VSTM1Q6UX27 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
VSTM1Q6UX27 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
VSTM1Q6UX27 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
VSTM1Q6UX27 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
VSTM1Q6UX27 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
VSTM1Q6UX27 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
VSTM1Q6UX27 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.35
VSTM1Q6UX27 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
VSTM1Q6UX27 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
VSTM1Q6UX27 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
VSTM1Q6UX27 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
VSTM1Q6UX27 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
VSTM1Q6UX27 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
VSTM1Q6UX27 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
VSTM1Q6UX27 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
VSTM1Q6UX27 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
VSTM1Q6UX27 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms