Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS9

Cacna2d2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d2Q6PHS9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Cacna2d2Q6PHS9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Cacna2d2Q6PHS9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cacna2d2Q6PHS9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cacna2d2Q6PHS9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cacna2d2Q6PHS9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cacna2d2Q6PHS9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cacna2d2Q6PHS9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cacna2d2Q6PHS9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cacna2d2Q6PHS9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cacna2d2Q6PHS9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cacna2d2Q6PHS9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cacna2d2Q6PHS9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cacna2d2Q6PHS9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cacna2d2Q6PHS9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Cacna2d2Q6PHS9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cacna2d2Q6PHS9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cacna2d2Q6PHS9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cacna2d2Q6PHS9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cacna2d2Q6PHS9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cacna2d2Q6PHS9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cacna2d2Q6PHS9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cacna2d2Q6PHS9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cacna2d2Q6PHS9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Cacna2d2Q6PHS9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cacna2d2Q6PHS9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cacna2d2Q6PHS9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cacna2d2Q6PHS9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cacna2d2Q6PHS9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cacna2d2Q6PHS9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cacna2d2Q6PHS9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cacna2d2Q6PHS9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cacna2d2Q6PHS9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cacna2d2Q6PHS9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Cacna2d2Q6PHS9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cacna2d2Q6PHS9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cacna2d2Q6PHS9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cacna2d2Q6PHS9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cacna2d2Q6PHS9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cacna2d2Q6PHS9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cacna2d2Q6PHS9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cacna2d2Q6PHS9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Cacna2d2Q6PHS9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cacna2d2Q6PHS9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cacna2d2Q6PHS9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cacna2d2Q6PHS9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cacna2d2Q6PHS9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cacna2d2Q6PHS9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cacna2d2Q6PHS9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cacna2d2Q6PHS9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cacna2d2Q6PHS9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cacna2d2Q6PHS9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cacna2d2Q6PHS9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Cacna2d2Q6PHS9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cacna2d2Q6PHS9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cacna2d2Q6PHS9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cacna2d2Q6PHS9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cacna2d2Q6PHS9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cacna2d2Q6PHS9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cacna2d2Q6PHS9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cacna2d2Q6PHS9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cacna2d2Q6PHS9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cacna2d2Q6PHS9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Cacna2d2Q6PHS9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cacna2d2Q6PHS9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cacna2d2Q6PHS9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cacna2d2Q6PHS9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cacna2d2Q6PHS9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cacna2d2Q6PHS9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cacna2d2Q6PHS9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cacna2d2Q6PHS9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cacna2d2Q6PHS9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Cacna2d2Q6PHS9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
Cacna2d2Q6PHS9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cacna2d2Q6PHS9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cacna2d2Q6PHS9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cacna2d2Q6PHS9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cacna2d2Q6PHS9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cacna2d2Q6PHS9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cacna2d2Q6PHS9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cacna2d2Q6PHS9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Cacna2d2Q6PHS9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cacna2d2Q6PHS9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cacna2d2Q6PHS9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cacna2d2Q6PHS9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cacna2d2Q6PHS9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cacna2d2Q6PHS9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cacna2d2Q6PHS9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cacna2d2Q6PHS9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cacna2d2Q6PHS9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cacna2d2Q6PHS9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cacna2d2Q6PHS9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cacna2d2Q6PHS9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cacna2d2Q6PHS9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cacna2d2Q6PHS9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cacna2d2Q6PHS9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cacna2d2Q6PHS9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cacna2d2Q6PHS9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cacna2d2Q6PHS9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cacna2d2Q6PHS9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms