Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM88Q6PEY1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM88Q6PEY1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM88Q6PEY1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM88Q6PEY1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM88Q6PEY1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM88Q6PEY1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM88Q6PEY1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM88Q6PEY1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM88Q6PEY1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM88Q6PEY1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM88Q6PEY1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM88Q6PEY1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM88Q6PEY1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM88Q6PEY1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM88Q6PEY1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM88Q6PEY1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM88Q6PEY1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM88Q6PEY1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM88Q6PEY1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM88Q6PEY1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM88Q6PEY1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM88Q6PEY1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM88Q6PEY1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM88Q6PEY1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM88Q6PEY1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM88Q6PEY1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM88Q6PEY1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM88Q6PEY1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM88Q6PEY1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM88Q6PEY1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM88Q6PEY1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM88Q6PEY1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM88Q6PEY1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM88Q6PEY1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM88Q6PEY1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM88Q6PEY1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM88Q6PEY1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM88Q6PEY1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM88Q6PEY1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM88Q6PEY1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM88Q6PEY1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM88Q6PEY1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM88Q6PEY1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM88Q6PEY1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM88Q6PEY1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM88Q6PEY1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM88Q6PEY1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM88Q6PEY1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM88Q6PEY1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM88Q6PEY1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM88Q6PEY1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM88Q6PEY1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM88Q6PEY1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM88Q6PEY1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM88Q6PEY1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM88Q6PEY1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM88Q6PEY1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM88Q6PEY1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM88Q6PEY1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM88Q6PEY1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM88Q6PEY1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM88Q6PEY1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM88Q6PEY1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM88Q6PEY1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM88Q6PEY1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM88Q6PEY1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM88Q6PEY1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM88Q6PEY1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM88Q6PEY1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM88Q6PEY1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM88Q6PEY1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM88Q6PEY1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM88Q6PEY1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM88Q6PEY1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM88Q6PEY1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TMEM88Q6PEY1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM88Q6PEY1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM88Q6PEY1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM88Q6PEY1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM88Q6PEY1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM88Q6PEY1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM88Q6PEY1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM88Q6PEY1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM88Q6PEY1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM88Q6PEY1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM88Q6PEY1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM88Q6PEY1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM88Q6PEY1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM88Q6PEY1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM88Q6PEY1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM88Q6PEY1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM88Q6PEY1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM88Q6PEY1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM88Q6PEY1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM88Q6PEY1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM88Q6PEY1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM88Q6PEY1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM88Q6PEY1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM88Q6PEY1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms