Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQT6

Scap, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScapQ6GQT6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ScapQ6GQT6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ScapQ6GQT6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ScapQ6GQT6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
ScapQ6GQT6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ScapQ6GQT6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ScapQ6GQT6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ScapQ6GQT6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ScapQ6GQT6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ScapQ6GQT6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ScapQ6GQT6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
ScapQ6GQT6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ScapQ6GQT6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ScapQ6GQT6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ScapQ6GQT6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ScapQ6GQT6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ScapQ6GQT6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ScapQ6GQT6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ScapQ6GQT6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ScapQ6GQT6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ScapQ6GQT6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ScapQ6GQT6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ScapQ6GQT6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ScapQ6GQT6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ScapQ6GQT6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
ScapQ6GQT6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ScapQ6GQT6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ScapQ6GQT6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ScapQ6GQT6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ScapQ6GQT6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ScapQ6GQT6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ScapQ6GQT6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ScapQ6GQT6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ScapQ6GQT6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ScapQ6GQT6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ScapQ6GQT6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ScapQ6GQT6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ScapQ6GQT6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ScapQ6GQT6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ScapQ6GQT6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ScapQ6GQT6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ScapQ6GQT6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ScapQ6GQT6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
ScapQ6GQT6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ScapQ6GQT6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ScapQ6GQT6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ScapQ6GQT6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ScapQ6GQT6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ScapQ6GQT6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ScapQ6GQT6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ScapQ6GQT6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ScapQ6GQT6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ScapQ6GQT6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ScapQ6GQT6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ScapQ6GQT6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ScapQ6GQT6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ScapQ6GQT6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ScapQ6GQT6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
ScapQ6GQT6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ScapQ6GQT6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ScapQ6GQT6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ScapQ6GQT6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ScapQ6GQT6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ScapQ6GQT6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ScapQ6GQT6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ScapQ6GQT6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ScapQ6GQT6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ScapQ6GQT6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ScapQ6GQT6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ScapQ6GQT6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ScapQ6GQT6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ScapQ6GQT6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ScapQ6GQT6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ScapQ6GQT6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ScapQ6GQT6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
ScapQ6GQT6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ScapQ6GQT6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ScapQ6GQT6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ScapQ6GQT6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ScapQ6GQT6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ScapQ6GQT6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ScapQ6GQT6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ScapQ6GQT6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ScapQ6GQT6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ScapQ6GQT6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ScapQ6GQT6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ScapQ6GQT6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ScapQ6GQT6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ScapQ6GQT6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ScapQ6GQT6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ScapQ6GQT6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ScapQ6GQT6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ScapQ6GQT6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ScapQ6GQT6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ScapQ6GQT6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ScapQ6GQT6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ScapQ6GQT6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ScapQ6GQT6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ScapQ6GQT6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ScapQ6GQT6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms