Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK9

Nlgn2, Neuroligin-2, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn2Q69ZK9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Nlgn2Q69ZK9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Nlgn2Q69ZK9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Nlgn2Q69ZK9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Nlgn2Q69ZK9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Nlgn2Q69ZK9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Nlgn2Q69ZK9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Nlgn2Q69ZK9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Nlgn2Q69ZK9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Nlgn2Q69ZK9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Nlgn2Q69ZK9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Nlgn2Q69ZK9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Nlgn2Q69ZK9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Nlgn2Q69ZK9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Nlgn2Q69ZK9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Nlgn2Q69ZK9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Nlgn2Q69ZK9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Nlgn2Q69ZK9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Nlgn2Q69ZK9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Nlgn2Q69ZK9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Nlgn2Q69ZK9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Nlgn2Q69ZK9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Nlgn2Q69ZK9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Nlgn2Q69ZK9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Nlgn2Q69ZK9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Nlgn2Q69ZK9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Nlgn2Q69ZK9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Nlgn2Q69ZK9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Nlgn2Q69ZK9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Nlgn2Q69ZK9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Nlgn2Q69ZK9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Nlgn2Q69ZK9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Nlgn2Q69ZK9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Nlgn2Q69ZK9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Nlgn2Q69ZK9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Nlgn2Q69ZK9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Nlgn2Q69ZK9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Nlgn2Q69ZK9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Nlgn2Q69ZK9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Nlgn2Q69ZK9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Nlgn2Q69ZK9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
Nlgn2Q69ZK9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Nlgn2Q69ZK9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Nlgn2Q69ZK9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Nlgn2Q69ZK9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Nlgn2Q69ZK9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Nlgn2Q69ZK9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Nlgn2Q69ZK9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Nlgn2Q69ZK9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Nlgn2Q69ZK9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Nlgn2Q69ZK9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Nlgn2Q69ZK9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Nlgn2Q69ZK9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Nlgn2Q69ZK9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Nlgn2Q69ZK9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Nlgn2Q69ZK9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Nlgn2Q69ZK9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Nlgn2Q69ZK9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Nlgn2Q69ZK9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Nlgn2Q69ZK9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Nlgn2Q69ZK9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Nlgn2Q69ZK9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
Nlgn2Q69ZK9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Nlgn2Q69ZK9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Nlgn2Q69ZK9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Nlgn2Q69ZK9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Nlgn2Q69ZK9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Nlgn2Q69ZK9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Nlgn2Q69ZK9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Nlgn2Q69ZK9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Nlgn2Q69ZK9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Nlgn2Q69ZK9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Nlgn2Q69ZK9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Nlgn2Q69ZK9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Nlgn2Q69ZK9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Nlgn2Q69ZK9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Nlgn2Q69ZK9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Nlgn2Q69ZK9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Nlgn2Q69ZK9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Nlgn2Q69ZK9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Nlgn2Q69ZK9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Nlgn2Q69ZK9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Nlgn2Q69ZK9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Nlgn2Q69ZK9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Nlgn2Q69ZK9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Nlgn2Q69ZK9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Nlgn2Q69ZK9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Nlgn2Q69ZK9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Nlgn2Q69ZK9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Nlgn2Q69ZK9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Nlgn2Q69ZK9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Nlgn2Q69ZK9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Nlgn2Q69ZK9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Nlgn2Q69ZK9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Nlgn2Q69ZK9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Nlgn2Q69ZK9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Nlgn2Q69ZK9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Nlgn2Q69ZK9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Nlgn2Q69ZK9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Nlgn2Q69ZK9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms