Protein–RNA interactions for Protein: Q62179

Sema4b, Semaphorin-4B, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4bQ62179 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Sema4bQ62179 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sema4bQ62179 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sema4bQ62179 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sema4bQ62179 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sema4bQ62179 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sema4bQ62179 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Sema4bQ62179 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Sema4bQ62179 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Sema4bQ62179 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Sema4bQ62179 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Sema4bQ62179 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sema4bQ62179 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sema4bQ62179 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sema4bQ62179 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Sema4bQ62179 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sema4bQ62179 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sema4bQ62179 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sema4bQ62179 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sema4bQ62179 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Sema4bQ62179 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Sema4bQ62179 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sema4bQ62179 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sema4bQ62179 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sema4bQ62179 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sema4bQ62179 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sema4bQ62179 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sema4bQ62179 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sema4bQ62179 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sema4bQ62179 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sema4bQ62179 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sema4bQ62179 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sema4bQ62179 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Sema4bQ62179 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Sema4bQ62179 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sema4bQ62179 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sema4bQ62179 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Sema4bQ62179 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sema4bQ62179 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sema4bQ62179 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sema4bQ62179 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Sema4bQ62179 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sema4bQ62179 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sema4bQ62179 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sema4bQ62179 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sema4bQ62179 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sema4bQ62179 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sema4bQ62179 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sema4bQ62179 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sema4bQ62179 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Sema4bQ62179 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sema4bQ62179 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sema4bQ62179 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Sema4bQ62179 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sema4bQ62179 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Sema4bQ62179 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sema4bQ62179 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sema4bQ62179 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sema4bQ62179 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Sema4bQ62179 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sema4bQ62179 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sema4bQ62179 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Sema4bQ62179 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sema4bQ62179 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sema4bQ62179 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sema4bQ62179 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sema4bQ62179 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sema4bQ62179 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sema4bQ62179 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sema4bQ62179 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sema4bQ62179 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sema4bQ62179 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sema4bQ62179 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sema4bQ62179 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sema4bQ62179 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Sema4bQ62179 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sema4bQ62179 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sema4bQ62179 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sema4bQ62179 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sema4bQ62179 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Sema4bQ62179 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sema4bQ62179 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Sema4bQ62179 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sema4bQ62179 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sema4bQ62179 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sema4bQ62179 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sema4bQ62179 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Sema4bQ62179 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sema4bQ62179 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sema4bQ62179 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sema4bQ62179 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sema4bQ62179 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sema4bQ62179 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sema4bQ62179 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sema4bQ62179 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sema4bQ62179 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sema4bQ62179 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sema4bQ62179 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sema4bQ62179 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sema4bQ62179 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms