Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prkd1Q62101 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prkd1Q62101 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Prkd1Q62101 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Prkd1Q62101 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prkd1Q62101 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prkd1Q62101 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prkd1Q62101 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prkd1Q62101 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prkd1Q62101 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Prkd1Q62101 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prkd1Q62101 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prkd1Q62101 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prkd1Q62101 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prkd1Q62101 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prkd1Q62101 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prkd1Q62101 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prkd1Q62101 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Prkd1Q62101 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prkd1Q62101 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prkd1Q62101 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prkd1Q62101 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prkd1Q62101 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prkd1Q62101 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prkd1Q62101 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prkd1Q62101 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prkd1Q62101 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prkd1Q62101 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prkd1Q62101 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prkd1Q62101 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prkd1Q62101 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prkd1Q62101 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prkd1Q62101 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prkd1Q62101 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prkd1Q62101 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prkd1Q62101 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Prkd1Q62101 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prkd1Q62101 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prkd1Q62101 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prkd1Q62101 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prkd1Q62101 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prkd1Q62101 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prkd1Q62101 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prkd1Q62101 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prkd1Q62101 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prkd1Q62101 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prkd1Q62101 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Prkd1Q62101 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prkd1Q62101 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prkd1Q62101 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prkd1Q62101 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prkd1Q62101 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prkd1Q62101 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prkd1Q62101 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prkd1Q62101 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prkd1Q62101 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prkd1Q62101 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prkd1Q62101 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prkd1Q62101 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prkd1Q62101 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prkd1Q62101 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prkd1Q62101 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prkd1Q62101 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prkd1Q62101 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prkd1Q62101 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prkd1Q62101 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prkd1Q62101 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prkd1Q62101 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Prkd1Q62101 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prkd1Q62101 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prkd1Q62101 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Prkd1Q62101 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prkd1Q62101 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prkd1Q62101 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prkd1Q62101 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prkd1Q62101 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prkd1Q62101 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Prkd1Q62101 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prkd1Q62101 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Prkd1Q62101 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prkd1Q62101 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prkd1Q62101 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prkd1Q62101 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prkd1Q62101 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prkd1Q62101 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prkd1Q62101 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prkd1Q62101 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Prkd1Q62101 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prkd1Q62101 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prkd1Q62101 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Prkd1Q62101 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Prkd1Q62101 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prkd1Q62101 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prkd1Q62101 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prkd1Q62101 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prkd1Q62101 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prkd1Q62101 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prkd1Q62101 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prkd1Q62101 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prkd1Q62101 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms