Protein–RNA interactions for Protein: Q61686

Cbx5, Chromobox protein homolog 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx5Q61686 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cbx5Q61686 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cbx5Q61686 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cbx5Q61686 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cbx5Q61686 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cbx5Q61686 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cbx5Q61686 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cbx5Q61686 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cbx5Q61686 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cbx5Q61686 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cbx5Q61686 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cbx5Q61686 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cbx5Q61686 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cbx5Q61686 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cbx5Q61686 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cbx5Q61686 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cbx5Q61686 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cbx5Q61686 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cbx5Q61686 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cbx5Q61686 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cbx5Q61686 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cbx5Q61686 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cbx5Q61686 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cbx5Q61686 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cbx5Q61686 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cbx5Q61686 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cbx5Q61686 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cbx5Q61686 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cbx5Q61686 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cbx5Q61686 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cbx5Q61686 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cbx5Q61686 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cbx5Q61686 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cbx5Q61686 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cbx5Q61686 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cbx5Q61686 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cbx5Q61686 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cbx5Q61686 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cbx5Q61686 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cbx5Q61686 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cbx5Q61686 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cbx5Q61686 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cbx5Q61686 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cbx5Q61686 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cbx5Q61686 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cbx5Q61686 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cbx5Q61686 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cbx5Q61686 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cbx5Q61686 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cbx5Q61686 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cbx5Q61686 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cbx5Q61686 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cbx5Q61686 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cbx5Q61686 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cbx5Q61686 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cbx5Q61686 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cbx5Q61686 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cbx5Q61686 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Cbx5Q61686 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cbx5Q61686 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cbx5Q61686 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cbx5Q61686 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cbx5Q61686 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cbx5Q61686 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cbx5Q61686 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cbx5Q61686 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cbx5Q61686 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cbx5Q61686 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cbx5Q61686 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cbx5Q61686 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cbx5Q61686 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cbx5Q61686 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cbx5Q61686 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cbx5Q61686 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cbx5Q61686 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cbx5Q61686 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cbx5Q61686 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cbx5Q61686 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cbx5Q61686 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cbx5Q61686 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cbx5Q61686 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cbx5Q61686 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cbx5Q61686 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cbx5Q61686 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cbx5Q61686 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cbx5Q61686 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cbx5Q61686 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cbx5Q61686 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cbx5Q61686 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cbx5Q61686 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cbx5Q61686 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cbx5Q61686 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cbx5Q61686 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cbx5Q61686 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cbx5Q61686 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cbx5Q61686 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cbx5Q61686 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cbx5Q61686 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cbx5Q61686 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cbx5Q61686 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms