Protein–RNA interactions for Protein: Q61646

Hp, Haptoglobin, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpQ61646 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HpQ61646 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HpQ61646 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HpQ61646 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HpQ61646 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HpQ61646 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HpQ61646 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HpQ61646 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HpQ61646 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HpQ61646 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HpQ61646 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HpQ61646 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HpQ61646 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HpQ61646 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HpQ61646 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HpQ61646 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HpQ61646 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HpQ61646 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HpQ61646 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HpQ61646 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HpQ61646 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HpQ61646 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HpQ61646 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HpQ61646 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HpQ61646 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HpQ61646 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HpQ61646 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HpQ61646 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HpQ61646 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HpQ61646 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HpQ61646 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HpQ61646 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HpQ61646 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HpQ61646 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HpQ61646 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HpQ61646 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HpQ61646 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HpQ61646 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HpQ61646 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HpQ61646 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HpQ61646 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HpQ61646 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HpQ61646 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HpQ61646 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HpQ61646 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HpQ61646 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HpQ61646 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HpQ61646 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HpQ61646 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HpQ61646 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HpQ61646 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HpQ61646 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HpQ61646 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HpQ61646 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HpQ61646 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HpQ61646 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HpQ61646 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HpQ61646 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HpQ61646 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HpQ61646 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HpQ61646 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HpQ61646 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HpQ61646 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HpQ61646 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HpQ61646 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HpQ61646 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HpQ61646 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HpQ61646 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HpQ61646 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HpQ61646 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HpQ61646 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HpQ61646 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HpQ61646 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HpQ61646 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HpQ61646 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HpQ61646 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HpQ61646 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HpQ61646 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HpQ61646 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HpQ61646 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HpQ61646 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HpQ61646 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HpQ61646 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HpQ61646 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HpQ61646 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HpQ61646 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HpQ61646 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HpQ61646 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HpQ61646 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HpQ61646 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HpQ61646 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HpQ61646 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HpQ61646 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HpQ61646 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HpQ61646 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HpQ61646 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HpQ61646 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HpQ61646 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HpQ61646 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HpQ61646 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms