Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHEQ5VZ18 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHEQ5VZ18 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHEQ5VZ18 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHEQ5VZ18 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHEQ5VZ18 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHEQ5VZ18 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SHEQ5VZ18 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHEQ5VZ18 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SHEQ5VZ18 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHEQ5VZ18 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHEQ5VZ18 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHEQ5VZ18 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHEQ5VZ18 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHEQ5VZ18 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHEQ5VZ18 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHEQ5VZ18 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHEQ5VZ18 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHEQ5VZ18 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHEQ5VZ18 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHEQ5VZ18 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHEQ5VZ18 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHEQ5VZ18 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHEQ5VZ18 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHEQ5VZ18 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHEQ5VZ18 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHEQ5VZ18 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SHEQ5VZ18 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHEQ5VZ18 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHEQ5VZ18 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHEQ5VZ18 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHEQ5VZ18 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHEQ5VZ18 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHEQ5VZ18 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHEQ5VZ18 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHEQ5VZ18 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHEQ5VZ18 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHEQ5VZ18 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SHEQ5VZ18 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHEQ5VZ18 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHEQ5VZ18 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHEQ5VZ18 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHEQ5VZ18 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHEQ5VZ18 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SHEQ5VZ18 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SHEQ5VZ18 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHEQ5VZ18 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHEQ5VZ18 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHEQ5VZ18 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHEQ5VZ18 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHEQ5VZ18 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHEQ5VZ18 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHEQ5VZ18 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHEQ5VZ18 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHEQ5VZ18 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHEQ5VZ18 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHEQ5VZ18 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHEQ5VZ18 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHEQ5VZ18 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHEQ5VZ18 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHEQ5VZ18 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHEQ5VZ18 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHEQ5VZ18 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHEQ5VZ18 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHEQ5VZ18 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHEQ5VZ18 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SHEQ5VZ18 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHEQ5VZ18 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHEQ5VZ18 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SHEQ5VZ18 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHEQ5VZ18 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHEQ5VZ18 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHEQ5VZ18 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHEQ5VZ18 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHEQ5VZ18 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SHEQ5VZ18 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHEQ5VZ18 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHEQ5VZ18 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SHEQ5VZ18 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHEQ5VZ18 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHEQ5VZ18 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHEQ5VZ18 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHEQ5VZ18 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHEQ5VZ18 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SHEQ5VZ18 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHEQ5VZ18 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHEQ5VZ18 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHEQ5VZ18 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SHEQ5VZ18 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHEQ5VZ18 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHEQ5VZ18 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SHEQ5VZ18 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHEQ5VZ18 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHEQ5VZ18 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHEQ5VZ18 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHEQ5VZ18 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHEQ5VZ18 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHEQ5VZ18 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHEQ5VZ18 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHEQ5VZ18 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms