Protein–RNA interactions for Protein: Q5JPI3

C3orf38, Uncharacterized protein C3orf38, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf38Q5JPI3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
C3orf38Q5JPI3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
C3orf38Q5JPI3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
C3orf38Q5JPI3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C3orf38Q5JPI3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
C3orf38Q5JPI3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C3orf38Q5JPI3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
C3orf38Q5JPI3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
C3orf38Q5JPI3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
C3orf38Q5JPI3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
C3orf38Q5JPI3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
C3orf38Q5JPI3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
C3orf38Q5JPI3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C3orf38Q5JPI3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C3orf38Q5JPI3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C3orf38Q5JPI3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
C3orf38Q5JPI3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C3orf38Q5JPI3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
C3orf38Q5JPI3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
C3orf38Q5JPI3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
C3orf38Q5JPI3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
C3orf38Q5JPI3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C3orf38Q5JPI3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
C3orf38Q5JPI3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
C3orf38Q5JPI3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
C3orf38Q5JPI3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
C3orf38Q5JPI3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
C3orf38Q5JPI3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
C3orf38Q5JPI3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
C3orf38Q5JPI3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C3orf38Q5JPI3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C3orf38Q5JPI3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
C3orf38Q5JPI3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
C3orf38Q5JPI3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
C3orf38Q5JPI3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
C3orf38Q5JPI3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
C3orf38Q5JPI3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
C3orf38Q5JPI3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C3orf38Q5JPI3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C3orf38Q5JPI3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
C3orf38Q5JPI3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
C3orf38Q5JPI3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C3orf38Q5JPI3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
C3orf38Q5JPI3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
C3orf38Q5JPI3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
C3orf38Q5JPI3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
C3orf38Q5JPI3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C3orf38Q5JPI3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C3orf38Q5JPI3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C3orf38Q5JPI3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C3orf38Q5JPI3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C3orf38Q5JPI3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.54■■■□□ 2
C3orf38Q5JPI3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
C3orf38Q5JPI3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C3orf38Q5JPI3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C3orf38Q5JPI3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C3orf38Q5JPI3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C3orf38Q5JPI3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C3orf38Q5JPI3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
C3orf38Q5JPI3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
C3orf38Q5JPI3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
C3orf38Q5JPI3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
C3orf38Q5JPI3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C3orf38Q5JPI3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C3orf38Q5JPI3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C3orf38Q5JPI3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
C3orf38Q5JPI3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C3orf38Q5JPI3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
C3orf38Q5JPI3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
C3orf38Q5JPI3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
C3orf38Q5JPI3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
C3orf38Q5JPI3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
C3orf38Q5JPI3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
C3orf38Q5JPI3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C3orf38Q5JPI3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C3orf38Q5JPI3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
C3orf38Q5JPI3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
C3orf38Q5JPI3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C3orf38Q5JPI3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
C3orf38Q5JPI3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C3orf38Q5JPI3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C3orf38Q5JPI3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C3orf38Q5JPI3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
C3orf38Q5JPI3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C3orf38Q5JPI3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C3orf38Q5JPI3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
C3orf38Q5JPI3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C3orf38Q5JPI3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
C3orf38Q5JPI3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
C3orf38Q5JPI3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
C3orf38Q5JPI3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
C3orf38Q5JPI3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C3orf38Q5JPI3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C3orf38Q5JPI3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C3orf38Q5JPI3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
C3orf38Q5JPI3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
C3orf38Q5JPI3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C3orf38Q5JPI3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
C3orf38Q5JPI3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C3orf38Q5JPI3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms