Protein–RNA interactions for Protein: Q5I0V9

2900092C05Rik, RIKEN cDNA 2900092C05, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2900092C05RikQ5I0V9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
2900092C05RikQ5I0V9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
2900092C05RikQ5I0V9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
2900092C05RikQ5I0V9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
2900092C05RikQ5I0V9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
2900092C05RikQ5I0V9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
2900092C05RikQ5I0V9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
2900092C05RikQ5I0V9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
2900092C05RikQ5I0V9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
2900092C05RikQ5I0V9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
2900092C05RikQ5I0V9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
2900092C05RikQ5I0V9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
2900092C05RikQ5I0V9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
2900092C05RikQ5I0V9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
2900092C05RikQ5I0V9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
2900092C05RikQ5I0V9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
2900092C05RikQ5I0V9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
2900092C05RikQ5I0V9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
2900092C05RikQ5I0V9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
2900092C05RikQ5I0V9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
2900092C05RikQ5I0V9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
2900092C05RikQ5I0V9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
2900092C05RikQ5I0V9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
2900092C05RikQ5I0V9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
2900092C05RikQ5I0V9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
2900092C05RikQ5I0V9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
2900092C05RikQ5I0V9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
2900092C05RikQ5I0V9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
2900092C05RikQ5I0V9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
2900092C05RikQ5I0V9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
2900092C05RikQ5I0V9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
2900092C05RikQ5I0V9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
2900092C05RikQ5I0V9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
2900092C05RikQ5I0V9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
2900092C05RikQ5I0V9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
2900092C05RikQ5I0V9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
2900092C05RikQ5I0V9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
2900092C05RikQ5I0V9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
2900092C05RikQ5I0V9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
2900092C05RikQ5I0V9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
2900092C05RikQ5I0V9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
2900092C05RikQ5I0V9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
2900092C05RikQ5I0V9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
2900092C05RikQ5I0V9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
2900092C05RikQ5I0V9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
2900092C05RikQ5I0V9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
2900092C05RikQ5I0V9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
2900092C05RikQ5I0V9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
2900092C05RikQ5I0V9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
2900092C05RikQ5I0V9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
2900092C05RikQ5I0V9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
2900092C05RikQ5I0V9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
2900092C05RikQ5I0V9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
2900092C05RikQ5I0V9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
2900092C05RikQ5I0V9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
2900092C05RikQ5I0V9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
2900092C05RikQ5I0V9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
2900092C05RikQ5I0V9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
2900092C05RikQ5I0V9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
2900092C05RikQ5I0V9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
2900092C05RikQ5I0V9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
2900092C05RikQ5I0V9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
2900092C05RikQ5I0V9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
2900092C05RikQ5I0V9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
2900092C05RikQ5I0V9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
2900092C05RikQ5I0V9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
2900092C05RikQ5I0V9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
2900092C05RikQ5I0V9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
2900092C05RikQ5I0V9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
2900092C05RikQ5I0V9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
2900092C05RikQ5I0V9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
2900092C05RikQ5I0V9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
2900092C05RikQ5I0V9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
2900092C05RikQ5I0V9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
2900092C05RikQ5I0V9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
2900092C05RikQ5I0V9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
2900092C05RikQ5I0V9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
2900092C05RikQ5I0V9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
2900092C05RikQ5I0V9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
2900092C05RikQ5I0V9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
2900092C05RikQ5I0V9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
2900092C05RikQ5I0V9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
2900092C05RikQ5I0V9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
2900092C05RikQ5I0V9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
2900092C05RikQ5I0V9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
2900092C05RikQ5I0V9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
2900092C05RikQ5I0V9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
2900092C05RikQ5I0V9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
2900092C05RikQ5I0V9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
2900092C05RikQ5I0V9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
2900092C05RikQ5I0V9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
2900092C05RikQ5I0V9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
2900092C05RikQ5I0V9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
2900092C05RikQ5I0V9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
2900092C05RikQ5I0V9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
2900092C05RikQ5I0V9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
2900092C05RikQ5I0V9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
2900092C05RikQ5I0V9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
2900092C05RikQ5I0V9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
2900092C05RikQ5I0V9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms