Protein–RNA interactions for Protein: Q53R12

TM4SF20, Transmembrane 4 L6 family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF20Q53R12 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF20Q53R12 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF20Q53R12 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF20Q53R12 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF20Q53R12 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM4SF20Q53R12 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF20Q53R12 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF20Q53R12 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF20Q53R12 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF20Q53R12 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF20Q53R12 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF20Q53R12 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF20Q53R12 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF20Q53R12 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TM4SF20Q53R12 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM4SF20Q53R12 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM4SF20Q53R12 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM4SF20Q53R12 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM4SF20Q53R12 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TM4SF20Q53R12 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TM4SF20Q53R12 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TM4SF20Q53R12 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TM4SF20Q53R12 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TM4SF20Q53R12 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TM4SF20Q53R12 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TM4SF20Q53R12 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TM4SF20Q53R12 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TM4SF20Q53R12 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TM4SF20Q53R12 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TM4SF20Q53R12 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TM4SF20Q53R12 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TM4SF20Q53R12 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TM4SF20Q53R12 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TM4SF20Q53R12 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TM4SF20Q53R12 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TM4SF20Q53R12 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TM4SF20Q53R12 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TM4SF20Q53R12 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TM4SF20Q53R12 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TM4SF20Q53R12 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TM4SF20Q53R12 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TM4SF20Q53R12 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TM4SF20Q53R12 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TM4SF20Q53R12 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TM4SF20Q53R12 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TM4SF20Q53R12 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TM4SF20Q53R12 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TM4SF20Q53R12 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TM4SF20Q53R12 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TM4SF20Q53R12 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TM4SF20Q53R12 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TM4SF20Q53R12 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TM4SF20Q53R12 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TM4SF20Q53R12 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TM4SF20Q53R12 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TM4SF20Q53R12 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TM4SF20Q53R12 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TM4SF20Q53R12 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TM4SF20Q53R12 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TM4SF20Q53R12 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TM4SF20Q53R12 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TM4SF20Q53R12 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM4SF20Q53R12 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM4SF20Q53R12 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM4SF20Q53R12 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TM4SF20Q53R12 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TM4SF20Q53R12 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TM4SF20Q53R12 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM4SF20Q53R12 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM4SF20Q53R12 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM4SF20Q53R12 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM4SF20Q53R12 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TM4SF20Q53R12 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM4SF20Q53R12 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM4SF20Q53R12 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM4SF20Q53R12 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM4SF20Q53R12 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM4SF20Q53R12 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM4SF20Q53R12 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TM4SF20Q53R12 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TM4SF20Q53R12 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM4SF20Q53R12 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM4SF20Q53R12 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM4SF20Q53R12 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM4SF20Q53R12 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM4SF20Q53R12 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM4SF20Q53R12 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM4SF20Q53R12 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM4SF20Q53R12 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM4SF20Q53R12 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM4SF20Q53R12 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM4SF20Q53R12 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM4SF20Q53R12 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TM4SF20Q53R12 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TM4SF20Q53R12 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF20Q53R12 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF20Q53R12 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF20Q53R12 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF20Q53R12 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF20Q53R12 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms