Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Skap2Q3UND0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Skap2Q3UND0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Skap2Q3UND0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Skap2Q3UND0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Skap2Q3UND0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Skap2Q3UND0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Skap2Q3UND0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Skap2Q3UND0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Skap2Q3UND0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Skap2Q3UND0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Skap2Q3UND0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Skap2Q3UND0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Skap2Q3UND0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Skap2Q3UND0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Skap2Q3UND0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Skap2Q3UND0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Skap2Q3UND0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Skap2Q3UND0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Skap2Q3UND0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Skap2Q3UND0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Skap2Q3UND0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Skap2Q3UND0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Skap2Q3UND0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Skap2Q3UND0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Skap2Q3UND0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Skap2Q3UND0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Skap2Q3UND0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Skap2Q3UND0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Skap2Q3UND0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Skap2Q3UND0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Skap2Q3UND0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Skap2Q3UND0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Skap2Q3UND0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Skap2Q3UND0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Skap2Q3UND0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Skap2Q3UND0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Skap2Q3UND0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Skap2Q3UND0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Skap2Q3UND0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Skap2Q3UND0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Skap2Q3UND0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Skap2Q3UND0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Skap2Q3UND0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Skap2Q3UND0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Skap2Q3UND0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Skap2Q3UND0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Skap2Q3UND0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Skap2Q3UND0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Skap2Q3UND0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Skap2Q3UND0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Skap2Q3UND0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Skap2Q3UND0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Skap2Q3UND0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Skap2Q3UND0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Skap2Q3UND0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Skap2Q3UND0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Skap2Q3UND0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Skap2Q3UND0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Skap2Q3UND0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Skap2Q3UND0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Skap2Q3UND0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Skap2Q3UND0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Skap2Q3UND0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Skap2Q3UND0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Skap2Q3UND0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Skap2Q3UND0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Skap2Q3UND0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Skap2Q3UND0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Skap2Q3UND0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Skap2Q3UND0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Skap2Q3UND0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Skap2Q3UND0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Skap2Q3UND0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Skap2Q3UND0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Skap2Q3UND0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Skap2Q3UND0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Skap2Q3UND0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Skap2Q3UND0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Skap2Q3UND0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Skap2Q3UND0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
Skap2Q3UND0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Skap2Q3UND0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Skap2Q3UND0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Skap2Q3UND0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Skap2Q3UND0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Skap2Q3UND0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Skap2Q3UND0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Skap2Q3UND0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Skap2Q3UND0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Skap2Q3UND0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Skap2Q3UND0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Skap2Q3UND0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Skap2Q3UND0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Skap2Q3UND0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Skap2Q3UND0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Skap2Q3UND0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Skap2Q3UND0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Skap2Q3UND0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Skap2Q3UND0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms