Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmem253Q3UNB8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmem253Q3UNB8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmem253Q3UNB8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmem253Q3UNB8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmem253Q3UNB8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmem253Q3UNB8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmem253Q3UNB8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmem253Q3UNB8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmem253Q3UNB8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmem253Q3UNB8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmem253Q3UNB8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmem253Q3UNB8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmem253Q3UNB8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmem253Q3UNB8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmem253Q3UNB8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmem253Q3UNB8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem253Q3UNB8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem253Q3UNB8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tmem253Q3UNB8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmem253Q3UNB8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmem253Q3UNB8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmem253Q3UNB8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmem253Q3UNB8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmem253Q3UNB8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem253Q3UNB8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem253Q3UNB8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmem253Q3UNB8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem253Q3UNB8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmem253Q3UNB8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmem253Q3UNB8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tmem253Q3UNB8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmem253Q3UNB8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmem253Q3UNB8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmem253Q3UNB8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmem253Q3UNB8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmem253Q3UNB8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmem253Q3UNB8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmem253Q3UNB8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmem253Q3UNB8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmem253Q3UNB8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmem253Q3UNB8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmem253Q3UNB8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmem253Q3UNB8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmem253Q3UNB8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmem253Q3UNB8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmem253Q3UNB8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmem253Q3UNB8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmem253Q3UNB8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmem253Q3UNB8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmem253Q3UNB8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmem253Q3UNB8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmem253Q3UNB8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmem253Q3UNB8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmem253Q3UNB8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmem253Q3UNB8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tmem253Q3UNB8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tmem253Q3UNB8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmem253Q3UNB8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmem253Q3UNB8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmem253Q3UNB8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmem253Q3UNB8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmem253Q3UNB8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmem253Q3UNB8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmem253Q3UNB8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmem253Q3UNB8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmem253Q3UNB8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmem253Q3UNB8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmem253Q3UNB8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tmem253Q3UNB8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmem253Q3UNB8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmem253Q3UNB8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmem253Q3UNB8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmem253Q3UNB8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmem253Q3UNB8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmem253Q3UNB8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmem253Q3UNB8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmem253Q3UNB8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem253Q3UNB8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem253Q3UNB8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem253Q3UNB8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem253Q3UNB8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmem253Q3UNB8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tmem253Q3UNB8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem253Q3UNB8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem253Q3UNB8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmem253Q3UNB8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmem253Q3UNB8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem253Q3UNB8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmem253Q3UNB8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmem253Q3UNB8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem253Q3UNB8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem253Q3UNB8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem253Q3UNB8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem253Q3UNB8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem253Q3UNB8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem253Q3UNB8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem253Q3UNB8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem253Q3UNB8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem253Q3UNB8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
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