Protein–RNA interactions for Protein: Q3UH93

Plxnd1, Plexin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 1,925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnd1Q3UH93 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Plxnd1Q3UH93 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Plxnd1Q3UH93 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Plxnd1Q3UH93 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Plxnd1Q3UH93 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Plxnd1Q3UH93 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Plxnd1Q3UH93 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Plxnd1Q3UH93 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Plxnd1Q3UH93 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Plxnd1Q3UH93 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Plxnd1Q3UH93 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Plxnd1Q3UH93 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Plxnd1Q3UH93 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Plxnd1Q3UH93 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Plxnd1Q3UH93 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Plxnd1Q3UH93 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Plxnd1Q3UH93 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Plxnd1Q3UH93 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Plxnd1Q3UH93 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Plxnd1Q3UH93 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Plxnd1Q3UH93 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Plxnd1Q3UH93 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Plxnd1Q3UH93 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Plxnd1Q3UH93 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Plxnd1Q3UH93 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Plxnd1Q3UH93 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Plxnd1Q3UH93 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Plxnd1Q3UH93 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Plxnd1Q3UH93 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Plxnd1Q3UH93 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Plxnd1Q3UH93 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Plxnd1Q3UH93 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Plxnd1Q3UH93 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Plxnd1Q3UH93 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Plxnd1Q3UH93 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Plxnd1Q3UH93 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Plxnd1Q3UH93 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Plxnd1Q3UH93 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Plxnd1Q3UH93 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Plxnd1Q3UH93 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Plxnd1Q3UH93 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Plxnd1Q3UH93 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Plxnd1Q3UH93 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Plxnd1Q3UH93 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Plxnd1Q3UH93 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Plxnd1Q3UH93 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Plxnd1Q3UH93 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Plxnd1Q3UH93 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Plxnd1Q3UH93 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Plxnd1Q3UH93 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Plxnd1Q3UH93 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Plxnd1Q3UH93 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Plxnd1Q3UH93 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Plxnd1Q3UH93 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Plxnd1Q3UH93 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Plxnd1Q3UH93 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Plxnd1Q3UH93 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Plxnd1Q3UH93 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Plxnd1Q3UH93 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Plxnd1Q3UH93 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Plxnd1Q3UH93 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Plxnd1Q3UH93 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Plxnd1Q3UH93 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Plxnd1Q3UH93 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Plxnd1Q3UH93 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Plxnd1Q3UH93 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Plxnd1Q3UH93 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Plxnd1Q3UH93 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Plxnd1Q3UH93 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Plxnd1Q3UH93 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Plxnd1Q3UH93 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Plxnd1Q3UH93 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Plxnd1Q3UH93 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Plxnd1Q3UH93 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Plxnd1Q3UH93 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Plxnd1Q3UH93 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Plxnd1Q3UH93 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Plxnd1Q3UH93 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Plxnd1Q3UH93 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Plxnd1Q3UH93 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Plxnd1Q3UH93 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Plxnd1Q3UH93 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Plxnd1Q3UH93 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Plxnd1Q3UH93 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Plxnd1Q3UH93 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Plxnd1Q3UH93 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Plxnd1Q3UH93 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Plxnd1Q3UH93 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Plxnd1Q3UH93 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Plxnd1Q3UH93 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Plxnd1Q3UH93 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Plxnd1Q3UH93 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Plxnd1Q3UH93 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Plxnd1Q3UH93 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Plxnd1Q3UH93 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Plxnd1Q3UH93 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Plxnd1Q3UH93 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Plxnd1Q3UH93 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Plxnd1Q3UH93 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Plxnd1Q3UH93 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms