Protein–RNA interactions for Protein: Q3U497

Cd300lb, CMRF35-like molecule 7, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lbQ3U497 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd300lbQ3U497 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd300lbQ3U497 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd300lbQ3U497 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd300lbQ3U497 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd300lbQ3U497 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd300lbQ3U497 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cd300lbQ3U497 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd300lbQ3U497 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd300lbQ3U497 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd300lbQ3U497 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd300lbQ3U497 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd300lbQ3U497 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd300lbQ3U497 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd300lbQ3U497 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd300lbQ3U497 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd300lbQ3U497 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd300lbQ3U497 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd300lbQ3U497 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd300lbQ3U497 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd300lbQ3U497 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cd300lbQ3U497 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd300lbQ3U497 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd300lbQ3U497 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd300lbQ3U497 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd300lbQ3U497 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd300lbQ3U497 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd300lbQ3U497 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd300lbQ3U497 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd300lbQ3U497 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd300lbQ3U497 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd300lbQ3U497 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd300lbQ3U497 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd300lbQ3U497 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd300lbQ3U497 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd300lbQ3U497 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd300lbQ3U497 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd300lbQ3U497 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd300lbQ3U497 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd300lbQ3U497 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd300lbQ3U497 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd300lbQ3U497 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cd300lbQ3U497 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd300lbQ3U497 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd300lbQ3U497 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd300lbQ3U497 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd300lbQ3U497 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd300lbQ3U497 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd300lbQ3U497 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd300lbQ3U497 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cd300lbQ3U497 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd300lbQ3U497 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd300lbQ3U497 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cd300lbQ3U497 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd300lbQ3U497 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd300lbQ3U497 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cd300lbQ3U497 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd300lbQ3U497 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cd300lbQ3U497 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd300lbQ3U497 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd300lbQ3U497 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd300lbQ3U497 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd300lbQ3U497 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd300lbQ3U497 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd300lbQ3U497 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd300lbQ3U497 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd300lbQ3U497 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd300lbQ3U497 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd300lbQ3U497 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd300lbQ3U497 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd300lbQ3U497 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd300lbQ3U497 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd300lbQ3U497 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd300lbQ3U497 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd300lbQ3U497 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd300lbQ3U497 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd300lbQ3U497 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd300lbQ3U497 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd300lbQ3U497 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd300lbQ3U497 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd300lbQ3U497 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd300lbQ3U497 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd300lbQ3U497 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd300lbQ3U497 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd300lbQ3U497 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd300lbQ3U497 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd300lbQ3U497 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd300lbQ3U497 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd300lbQ3U497 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd300lbQ3U497 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd300lbQ3U497 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd300lbQ3U497 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd300lbQ3U497 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd300lbQ3U497 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd300lbQ3U497 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd300lbQ3U497 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd300lbQ3U497 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Cd300lbQ3U497 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cd300lbQ3U497 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd300lbQ3U497 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms