Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hectd3Q3U487 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hectd3Q3U487 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hectd3Q3U487 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hectd3Q3U487 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hectd3Q3U487 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hectd3Q3U487 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hectd3Q3U487 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hectd3Q3U487 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hectd3Q3U487 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hectd3Q3U487 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Hectd3Q3U487 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hectd3Q3U487 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hectd3Q3U487 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hectd3Q3U487 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hectd3Q3U487 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hectd3Q3U487 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hectd3Q3U487 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hectd3Q3U487 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hectd3Q3U487 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Hectd3Q3U487 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hectd3Q3U487 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hectd3Q3U487 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hectd3Q3U487 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hectd3Q3U487 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hectd3Q3U487 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Hectd3Q3U487 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hectd3Q3U487 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hectd3Q3U487 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hectd3Q3U487 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Hectd3Q3U487 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Hectd3Q3U487 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hectd3Q3U487 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hectd3Q3U487 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hectd3Q3U487 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hectd3Q3U487 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hectd3Q3U487 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hectd3Q3U487 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hectd3Q3U487 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hectd3Q3U487 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hectd3Q3U487 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hectd3Q3U487 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Hectd3Q3U487 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hectd3Q3U487 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hectd3Q3U487 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hectd3Q3U487 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hectd3Q3U487 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hectd3Q3U487 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hectd3Q3U487 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Hectd3Q3U487 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hectd3Q3U487 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hectd3Q3U487 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hectd3Q3U487 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hectd3Q3U487 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hectd3Q3U487 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hectd3Q3U487 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hectd3Q3U487 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hectd3Q3U487 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hectd3Q3U487 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hectd3Q3U487 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hectd3Q3U487 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hectd3Q3U487 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hectd3Q3U487 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hectd3Q3U487 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hectd3Q3U487 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hectd3Q3U487 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hectd3Q3U487 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hectd3Q3U487 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Hectd3Q3U487 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hectd3Q3U487 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hectd3Q3U487 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hectd3Q3U487 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hectd3Q3U487 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Hectd3Q3U487 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hectd3Q3U487 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hectd3Q3U487 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hectd3Q3U487 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Hectd3Q3U487 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hectd3Q3U487 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Hectd3Q3U487 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hectd3Q3U487 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hectd3Q3U487 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hectd3Q3U487 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hectd3Q3U487 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hectd3Q3U487 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hectd3Q3U487 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hectd3Q3U487 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hectd3Q3U487 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hectd3Q3U487 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hectd3Q3U487 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hectd3Q3U487 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hectd3Q3U487 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hectd3Q3U487 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hectd3Q3U487 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hectd3Q3U487 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hectd3Q3U487 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hectd3Q3U487 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hectd3Q3U487 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hectd3Q3U487 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hectd3Q3U487 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms