Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
InipQ3TXT3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
InipQ3TXT3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
InipQ3TXT3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
InipQ3TXT3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
InipQ3TXT3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
InipQ3TXT3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
InipQ3TXT3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
InipQ3TXT3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
InipQ3TXT3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
InipQ3TXT3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
InipQ3TXT3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
InipQ3TXT3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
InipQ3TXT3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
InipQ3TXT3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
InipQ3TXT3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
InipQ3TXT3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
InipQ3TXT3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
InipQ3TXT3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
InipQ3TXT3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
InipQ3TXT3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
InipQ3TXT3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
InipQ3TXT3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
InipQ3TXT3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
InipQ3TXT3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
InipQ3TXT3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
InipQ3TXT3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
InipQ3TXT3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
InipQ3TXT3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
InipQ3TXT3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
InipQ3TXT3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
InipQ3TXT3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
InipQ3TXT3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
InipQ3TXT3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
InipQ3TXT3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
InipQ3TXT3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
InipQ3TXT3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
InipQ3TXT3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
InipQ3TXT3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
InipQ3TXT3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
InipQ3TXT3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
InipQ3TXT3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
InipQ3TXT3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
InipQ3TXT3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
InipQ3TXT3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
InipQ3TXT3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
InipQ3TXT3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
InipQ3TXT3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
InipQ3TXT3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
InipQ3TXT3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
InipQ3TXT3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
InipQ3TXT3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
InipQ3TXT3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
InipQ3TXT3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
InipQ3TXT3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
InipQ3TXT3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
InipQ3TXT3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
InipQ3TXT3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
InipQ3TXT3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
InipQ3TXT3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
InipQ3TXT3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
InipQ3TXT3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
InipQ3TXT3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
InipQ3TXT3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
InipQ3TXT3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
InipQ3TXT3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
InipQ3TXT3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
InipQ3TXT3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
InipQ3TXT3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
InipQ3TXT3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
InipQ3TXT3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
InipQ3TXT3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
InipQ3TXT3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
InipQ3TXT3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
InipQ3TXT3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
InipQ3TXT3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
InipQ3TXT3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
InipQ3TXT3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
InipQ3TXT3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
InipQ3TXT3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
InipQ3TXT3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
InipQ3TXT3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
InipQ3TXT3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
InipQ3TXT3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
InipQ3TXT3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
InipQ3TXT3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
InipQ3TXT3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
InipQ3TXT3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
InipQ3TXT3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
InipQ3TXT3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
InipQ3TXT3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
InipQ3TXT3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
InipQ3TXT3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
InipQ3TXT3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
InipQ3TXT3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
InipQ3TXT3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
InipQ3TXT3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
InipQ3TXT3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
InipQ3TXT3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
InipQ3TXT3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms