Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRM8

Hk3, Hexokinase-3, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hk3Q3TRM8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Hk3Q3TRM8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.54■■■□□ 2
Hk3Q3TRM8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Hk3Q3TRM8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hk3Q3TRM8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hk3Q3TRM8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hk3Q3TRM8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hk3Q3TRM8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hk3Q3TRM8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hk3Q3TRM8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hk3Q3TRM8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Hk3Q3TRM8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hk3Q3TRM8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hk3Q3TRM8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hk3Q3TRM8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hk3Q3TRM8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hk3Q3TRM8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hk3Q3TRM8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hk3Q3TRM8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Hk3Q3TRM8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hk3Q3TRM8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hk3Q3TRM8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hk3Q3TRM8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hk3Q3TRM8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hk3Q3TRM8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hk3Q3TRM8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hk3Q3TRM8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hk3Q3TRM8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hk3Q3TRM8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hk3Q3TRM8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hk3Q3TRM8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hk3Q3TRM8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Hk3Q3TRM8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hk3Q3TRM8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hk3Q3TRM8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Hk3Q3TRM8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Hk3Q3TRM8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hk3Q3TRM8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hk3Q3TRM8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hk3Q3TRM8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hk3Q3TRM8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hk3Q3TRM8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hk3Q3TRM8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hk3Q3TRM8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hk3Q3TRM8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hk3Q3TRM8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hk3Q3TRM8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hk3Q3TRM8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hk3Q3TRM8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hk3Q3TRM8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hk3Q3TRM8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hk3Q3TRM8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hk3Q3TRM8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Hk3Q3TRM8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hk3Q3TRM8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hk3Q3TRM8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Hk3Q3TRM8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hk3Q3TRM8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hk3Q3TRM8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Hk3Q3TRM8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hk3Q3TRM8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hk3Q3TRM8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hk3Q3TRM8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hk3Q3TRM8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hk3Q3TRM8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Hk3Q3TRM8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hk3Q3TRM8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hk3Q3TRM8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Hk3Q3TRM8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hk3Q3TRM8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hk3Q3TRM8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hk3Q3TRM8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hk3Q3TRM8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hk3Q3TRM8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hk3Q3TRM8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hk3Q3TRM8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hk3Q3TRM8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hk3Q3TRM8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hk3Q3TRM8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hk3Q3TRM8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hk3Q3TRM8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hk3Q3TRM8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hk3Q3TRM8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Hk3Q3TRM8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Hk3Q3TRM8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hk3Q3TRM8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hk3Q3TRM8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hk3Q3TRM8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hk3Q3TRM8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hk3Q3TRM8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Hk3Q3TRM8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hk3Q3TRM8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hk3Q3TRM8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hk3Q3TRM8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hk3Q3TRM8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hk3Q3TRM8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hk3Q3TRM8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hk3Q3TRM8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hk3Q3TRM8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hk3Q3TRM8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms