Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRTAP13-3Q3SY46 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRTAP13-3Q3SY46 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRTAP13-3Q3SY46 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KRTAP13-3Q3SY46 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRTAP13-3Q3SY46 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRTAP13-3Q3SY46 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRTAP13-3Q3SY46 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRTAP13-3Q3SY46 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRTAP13-3Q3SY46 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRTAP13-3Q3SY46 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP13-3Q3SY46 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP13-3Q3SY46 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP13-3Q3SY46 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP13-3Q3SY46 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP13-3Q3SY46 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP13-3Q3SY46 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP13-3Q3SY46 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP13-3Q3SY46 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP13-3Q3SY46 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP13-3Q3SY46 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP13-3Q3SY46 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP13-3Q3SY46 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP13-3Q3SY46 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP13-3Q3SY46 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP13-3Q3SY46 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP13-3Q3SY46 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP13-3Q3SY46 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP13-3Q3SY46 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP13-3Q3SY46 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
KRTAP13-3Q3SY46 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP13-3Q3SY46 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP13-3Q3SY46 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP13-3Q3SY46 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP13-3Q3SY46 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP13-3Q3SY46 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP13-3Q3SY46 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP13-3Q3SY46 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP13-3Q3SY46 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP13-3Q3SY46 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRTAP13-3Q3SY46 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP13-3Q3SY46 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP13-3Q3SY46 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP13-3Q3SY46 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP13-3Q3SY46 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP13-3Q3SY46 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP13-3Q3SY46 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRTAP13-3Q3SY46 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRTAP13-3Q3SY46 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRTAP13-3Q3SY46 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRTAP13-3Q3SY46 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP13-3Q3SY46 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP13-3Q3SY46 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP13-3Q3SY46 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP13-3Q3SY46 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP13-3Q3SY46 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP13-3Q3SY46 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP13-3Q3SY46 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP13-3Q3SY46 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP13-3Q3SY46 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP13-3Q3SY46 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP13-3Q3SY46 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRTAP13-3Q3SY46 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRTAP13-3Q3SY46 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP13-3Q3SY46 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP13-3Q3SY46 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP13-3Q3SY46 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP13-3Q3SY46 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP13-3Q3SY46 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP13-3Q3SY46 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP13-3Q3SY46 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP13-3Q3SY46 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRTAP13-3Q3SY46 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP13-3Q3SY46 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP13-3Q3SY46 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP13-3Q3SY46 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP13-3Q3SY46 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP13-3Q3SY46 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP13-3Q3SY46 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRTAP13-3Q3SY46 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRTAP13-3Q3SY46 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP13-3Q3SY46 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRTAP13-3Q3SY46 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRTAP13-3Q3SY46 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRTAP13-3Q3SY46 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRTAP13-3Q3SY46 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KRTAP13-3Q3SY46 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRTAP13-3Q3SY46 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRTAP13-3Q3SY46 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRTAP13-3Q3SY46 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRTAP13-3Q3SY46 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRTAP13-3Q3SY46 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KRTAP13-3Q3SY46 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KRTAP13-3Q3SY46 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KRTAP13-3Q3SY46 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.4 ms